Protein–RNA interactions for Protein: Q5TYX0

PRAMEF5, PRAME family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF5Q5TYX0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF5Q5TYX0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF5Q5TYX0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF5Q5TYX0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF5Q5TYX0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF5Q5TYX0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF5Q5TYX0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF5Q5TYX0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF5Q5TYX0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF5Q5TYX0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF5Q5TYX0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF5Q5TYX0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF5Q5TYX0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF5Q5TYX0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF5Q5TYX0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF5Q5TYX0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF5Q5TYX0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF5Q5TYX0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF5Q5TYX0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF5Q5TYX0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRAMEF5Q5TYX0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF5Q5TYX0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF5Q5TYX0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF5Q5TYX0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF5Q5TYX0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF5Q5TYX0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF5Q5TYX0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF5Q5TYX0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF5Q5TYX0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF5Q5TYX0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF5Q5TYX0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF5Q5TYX0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF5Q5TYX0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF5Q5TYX0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF5Q5TYX0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF5Q5TYX0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRAMEF5Q5TYX0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF5Q5TYX0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF5Q5TYX0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF5Q5TYX0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF5Q5TYX0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF5Q5TYX0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF5Q5TYX0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF5Q5TYX0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF5Q5TYX0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF5Q5TYX0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF5Q5TYX0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF5Q5TYX0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PRAMEF5Q5TYX0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF5Q5TYX0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF5Q5TYX0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF5Q5TYX0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF5Q5TYX0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF5Q5TYX0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF5Q5TYX0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF5Q5TYX0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF5Q5TYX0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF5Q5TYX0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF5Q5TYX0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF5Q5TYX0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF5Q5TYX0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF5Q5TYX0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF5Q5TYX0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF5Q5TYX0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF5Q5TYX0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF5Q5TYX0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF5Q5TYX0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF5Q5TYX0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF5Q5TYX0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF5Q5TYX0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF5Q5TYX0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF5Q5TYX0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF5Q5TYX0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF5Q5TYX0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF5Q5TYX0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF5Q5TYX0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF5Q5TYX0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF5Q5TYX0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF5Q5TYX0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF5Q5TYX0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF5Q5TYX0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF5Q5TYX0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF5Q5TYX0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF5Q5TYX0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF5Q5TYX0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF5Q5TYX0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF5Q5TYX0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF5Q5TYX0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF5Q5TYX0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF5Q5TYX0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF5Q5TYX0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF5Q5TYX0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF5Q5TYX0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF5Q5TYX0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF5Q5TYX0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRAMEF5Q5TYX0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF5Q5TYX0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF5Q5TYX0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF5Q5TYX0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF5Q5TYX0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms