Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6R2

TPTE2P1, Putative phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2P1, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2P1Q5T6R2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPTE2P1Q5T6R2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPTE2P1Q5T6R2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPTE2P1Q5T6R2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPTE2P1Q5T6R2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPTE2P1Q5T6R2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPTE2P1Q5T6R2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPTE2P1Q5T6R2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPTE2P1Q5T6R2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPTE2P1Q5T6R2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPTE2P1Q5T6R2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPTE2P1Q5T6R2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPTE2P1Q5T6R2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPTE2P1Q5T6R2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPTE2P1Q5T6R2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPTE2P1Q5T6R2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPTE2P1Q5T6R2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPTE2P1Q5T6R2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPTE2P1Q5T6R2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPTE2P1Q5T6R2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TPTE2P1Q5T6R2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPTE2P1Q5T6R2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPTE2P1Q5T6R2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPTE2P1Q5T6R2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPTE2P1Q5T6R2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPTE2P1Q5T6R2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPTE2P1Q5T6R2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPTE2P1Q5T6R2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPTE2P1Q5T6R2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPTE2P1Q5T6R2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPTE2P1Q5T6R2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPTE2P1Q5T6R2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPTE2P1Q5T6R2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPTE2P1Q5T6R2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPTE2P1Q5T6R2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPTE2P1Q5T6R2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPTE2P1Q5T6R2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPTE2P1Q5T6R2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPTE2P1Q5T6R2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPTE2P1Q5T6R2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPTE2P1Q5T6R2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPTE2P1Q5T6R2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPTE2P1Q5T6R2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPTE2P1Q5T6R2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPTE2P1Q5T6R2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPTE2P1Q5T6R2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPTE2P1Q5T6R2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPTE2P1Q5T6R2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPTE2P1Q5T6R2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPTE2P1Q5T6R2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPTE2P1Q5T6R2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TPTE2P1Q5T6R2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPTE2P1Q5T6R2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPTE2P1Q5T6R2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPTE2P1Q5T6R2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPTE2P1Q5T6R2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPTE2P1Q5T6R2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPTE2P1Q5T6R2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPTE2P1Q5T6R2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPTE2P1Q5T6R2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPTE2P1Q5T6R2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPTE2P1Q5T6R2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPTE2P1Q5T6R2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPTE2P1Q5T6R2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPTE2P1Q5T6R2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TPTE2P1Q5T6R2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPTE2P1Q5T6R2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPTE2P1Q5T6R2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPTE2P1Q5T6R2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPTE2P1Q5T6R2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPTE2P1Q5T6R2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPTE2P1Q5T6R2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPTE2P1Q5T6R2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPTE2P1Q5T6R2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPTE2P1Q5T6R2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPTE2P1Q5T6R2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPTE2P1Q5T6R2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPTE2P1Q5T6R2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPTE2P1Q5T6R2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPTE2P1Q5T6R2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPTE2P1Q5T6R2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TPTE2P1Q5T6R2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TPTE2P1Q5T6R2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPTE2P1Q5T6R2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPTE2P1Q5T6R2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPTE2P1Q5T6R2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPTE2P1Q5T6R2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPTE2P1Q5T6R2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPTE2P1Q5T6R2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPTE2P1Q5T6R2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TPTE2P1Q5T6R2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPTE2P1Q5T6R2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPTE2P1Q5T6R2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPTE2P1Q5T6R2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPTE2P1Q5T6R2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPTE2P1Q5T6R2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPTE2P1Q5T6R2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPTE2P1Q5T6R2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPTE2P1Q5T6R2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPTE2P1Q5T6R2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms