Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC39.37■■■■□ 3.89
NHSL1Q5SYE7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC39.36■■■■□ 3.89
NHSL1Q5SYE7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
NHSL1Q5SYE7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC39.35■■■■□ 3.89
NHSL1Q5SYE7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
NHSL1Q5SYE7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
NHSL1Q5SYE7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
NHSL1Q5SYE7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC39.33■■■■□ 3.89
NHSL1Q5SYE7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
NHSL1Q5SYE7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
NHSL1Q5SYE7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC39.27■■■■□ 3.88
NHSL1Q5SYE7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
NHSL1Q5SYE7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC39.25■■■■□ 3.87
NHSL1Q5SYE7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
NHSL1Q5SYE7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
NHSL1Q5SYE7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
NHSL1Q5SYE7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC39.22■■■■□ 3.87
NHSL1Q5SYE7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC39.22■■■■□ 3.87
NHSL1Q5SYE7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
NHSL1Q5SYE7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC39.2■■■■□ 3.87
NHSL1Q5SYE7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
NHSL1Q5SYE7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
NHSL1Q5SYE7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
NHSL1Q5SYE7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
NHSL1Q5SYE7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
NHSL1Q5SYE7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC39.13■■■■□ 3.85
NHSL1Q5SYE7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
NHSL1Q5SYE7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
NHSL1Q5SYE7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC39.07■■■■□ 3.85
NHSL1Q5SYE7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.84
NHSL1Q5SYE7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
NHSL1Q5SYE7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
NHSL1Q5SYE7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
NHSL1Q5SYE7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
NHSL1Q5SYE7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.02■■■■□ 3.84
NHSL1Q5SYE7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
NHSL1Q5SYE7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
NHSL1Q5SYE7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
NHSL1Q5SYE7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC38.97■■■■□ 3.83
NHSL1Q5SYE7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
NHSL1Q5SYE7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
NHSL1Q5SYE7 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
NHSL1Q5SYE7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC38.89■■■■□ 3.82
NHSL1Q5SYE7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
NHSL1Q5SYE7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
NHSL1Q5SYE7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
NHSL1Q5SYE7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
NHSL1Q5SYE7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
NHSL1Q5SYE7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
NHSL1Q5SYE7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
NHSL1Q5SYE7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
NHSL1Q5SYE7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
NHSL1Q5SYE7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC38.81■■■■□ 3.8
NHSL1Q5SYE7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
NHSL1Q5SYE7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
NHSL1Q5SYE7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
NHSL1Q5SYE7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC38.8■■■■□ 3.8
NHSL1Q5SYE7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC38.78■■■■□ 3.8
NHSL1Q5SYE7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC38.78■■■■□ 3.8
NHSL1Q5SYE7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
NHSL1Q5SYE7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC38.73■■■■□ 3.79
NHSL1Q5SYE7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
NHSL1Q5SYE7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
NHSL1Q5SYE7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
NHSL1Q5SYE7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
NHSL1Q5SYE7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC38.65■■■■□ 3.78
NHSL1Q5SYE7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC38.65■■■■□ 3.78
NHSL1Q5SYE7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
NHSL1Q5SYE7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
NHSL1Q5SYE7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
NHSL1Q5SYE7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
NHSL1Q5SYE7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
NHSL1Q5SYE7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC38.59■■■■□ 3.77
NHSL1Q5SYE7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
NHSL1Q5SYE7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
NHSL1Q5SYE7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
NHSL1Q5SYE7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
NHSL1Q5SYE7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
NHSL1Q5SYE7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
NHSL1Q5SYE7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
NHSL1Q5SYE7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
NHSL1Q5SYE7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
NHSL1Q5SYE7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
NHSL1Q5SYE7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.52■■■■□ 3.76
NHSL1Q5SYE7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
NHSL1Q5SYE7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
NHSL1Q5SYE7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
NHSL1Q5SYE7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.48■■■■□ 3.75
NHSL1Q5SYE7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
NHSL1Q5SYE7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
NHSL1Q5SYE7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
NHSL1Q5SYE7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC38.39■■■■□ 3.74
NHSL1Q5SYE7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
NHSL1Q5SYE7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
NHSL1Q5SYE7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
NHSL1Q5SYE7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC38.36■■■■□ 3.73
NHSL1Q5SYE7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
NHSL1Q5SYE7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
NHSL1Q5SYE7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
NHSL1Q5SYE7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms