Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBN2

TRIM61, Putative tripartite motif-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM61Q5EBN2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM61Q5EBN2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM61Q5EBN2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM61Q5EBN2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM61Q5EBN2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM61Q5EBN2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM61Q5EBN2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM61Q5EBN2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM61Q5EBN2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM61Q5EBN2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM61Q5EBN2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM61Q5EBN2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM61Q5EBN2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM61Q5EBN2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM61Q5EBN2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM61Q5EBN2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM61Q5EBN2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM61Q5EBN2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM61Q5EBN2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM61Q5EBN2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM61Q5EBN2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM61Q5EBN2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM61Q5EBN2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM61Q5EBN2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM61Q5EBN2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM61Q5EBN2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM61Q5EBN2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM61Q5EBN2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM61Q5EBN2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM61Q5EBN2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM61Q5EBN2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM61Q5EBN2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM61Q5EBN2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM61Q5EBN2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM61Q5EBN2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM61Q5EBN2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM61Q5EBN2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM61Q5EBN2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM61Q5EBN2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRIM61Q5EBN2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM61Q5EBN2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM61Q5EBN2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM61Q5EBN2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM61Q5EBN2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TRIM61Q5EBN2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM61Q5EBN2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM61Q5EBN2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM61Q5EBN2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TRIM61Q5EBN2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM61Q5EBN2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM61Q5EBN2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM61Q5EBN2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM61Q5EBN2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM61Q5EBN2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM61Q5EBN2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM61Q5EBN2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM61Q5EBN2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM61Q5EBN2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM61Q5EBN2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM61Q5EBN2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM61Q5EBN2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM61Q5EBN2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM61Q5EBN2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM61Q5EBN2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM61Q5EBN2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM61Q5EBN2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM61Q5EBN2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM61Q5EBN2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM61Q5EBN2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM61Q5EBN2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM61Q5EBN2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM61Q5EBN2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM61Q5EBN2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM61Q5EBN2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM61Q5EBN2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM61Q5EBN2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM61Q5EBN2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM61Q5EBN2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM61Q5EBN2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM61Q5EBN2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM61Q5EBN2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM61Q5EBN2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM61Q5EBN2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM61Q5EBN2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM61Q5EBN2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM61Q5EBN2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM61Q5EBN2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM61Q5EBN2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM61Q5EBN2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM61Q5EBN2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM61Q5EBN2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM61Q5EBN2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM61Q5EBN2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM61Q5EBN2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM61Q5EBN2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM61Q5EBN2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM61Q5EBN2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM61Q5EBN2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM61Q5EBN2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM61Q5EBN2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms