Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMEM259Q4ZIN3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMEM259Q4ZIN3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM259Q4ZIN3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMEM259Q4ZIN3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMEM259Q4ZIN3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMEM259Q4ZIN3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMEM259Q4ZIN3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMEM259Q4ZIN3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMEM259Q4ZIN3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMEM259Q4ZIN3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMEM259Q4ZIN3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM259Q4ZIN3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM259Q4ZIN3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM259Q4ZIN3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMEM259Q4ZIN3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMEM259Q4ZIN3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMEM259Q4ZIN3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMEM259Q4ZIN3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMEM259Q4ZIN3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMEM259Q4ZIN3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMEM259Q4ZIN3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMEM259Q4ZIN3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMEM259Q4ZIN3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMEM259Q4ZIN3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM259Q4ZIN3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM259Q4ZIN3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM259Q4ZIN3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMEM259Q4ZIN3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMEM259Q4ZIN3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TMEM259Q4ZIN3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMEM259Q4ZIN3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMEM259Q4ZIN3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TMEM259Q4ZIN3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMEM259Q4ZIN3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMEM259Q4ZIN3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMEM259Q4ZIN3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMEM259Q4ZIN3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TMEM259Q4ZIN3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMEM259Q4ZIN3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMEM259Q4ZIN3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMEM259Q4ZIN3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMEM259Q4ZIN3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMEM259Q4ZIN3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMEM259Q4ZIN3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMEM259Q4ZIN3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMEM259Q4ZIN3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMEM259Q4ZIN3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMEM259Q4ZIN3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMEM259Q4ZIN3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM259Q4ZIN3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM259Q4ZIN3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMEM259Q4ZIN3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMEM259Q4ZIN3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMEM259Q4ZIN3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMEM259Q4ZIN3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMEM259Q4ZIN3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMEM259Q4ZIN3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMEM259Q4ZIN3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMEM259Q4ZIN3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMEM259Q4ZIN3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMEM259Q4ZIN3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMEM259Q4ZIN3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMEM259Q4ZIN3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMEM259Q4ZIN3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM259Q4ZIN3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM259Q4ZIN3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TMEM259Q4ZIN3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM259Q4ZIN3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TMEM259Q4ZIN3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM259Q4ZIN3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM259Q4ZIN3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMEM259Q4ZIN3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMEM259Q4ZIN3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMEM259Q4ZIN3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMEM259Q4ZIN3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMEM259Q4ZIN3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMEM259Q4ZIN3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMEM259Q4ZIN3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM259Q4ZIN3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM259Q4ZIN3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM259Q4ZIN3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMEM259Q4ZIN3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM259Q4ZIN3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM259Q4ZIN3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM259Q4ZIN3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM259Q4ZIN3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM259Q4ZIN3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM259Q4ZIN3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM259Q4ZIN3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM259Q4ZIN3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM259Q4ZIN3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM259Q4ZIN3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM259Q4ZIN3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM259Q4ZIN3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM259Q4ZIN3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM259Q4ZIN3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM259Q4ZIN3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM259Q4ZIN3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms