Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCGF3Q3KNV8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCGF3Q3KNV8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCGF3Q3KNV8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCGF3Q3KNV8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCGF3Q3KNV8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCGF3Q3KNV8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCGF3Q3KNV8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PCGF3Q3KNV8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCGF3Q3KNV8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCGF3Q3KNV8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCGF3Q3KNV8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCGF3Q3KNV8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCGF3Q3KNV8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCGF3Q3KNV8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCGF3Q3KNV8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCGF3Q3KNV8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCGF3Q3KNV8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCGF3Q3KNV8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCGF3Q3KNV8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCGF3Q3KNV8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCGF3Q3KNV8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCGF3Q3KNV8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCGF3Q3KNV8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCGF3Q3KNV8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCGF3Q3KNV8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCGF3Q3KNV8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCGF3Q3KNV8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCGF3Q3KNV8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCGF3Q3KNV8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCGF3Q3KNV8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCGF3Q3KNV8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCGF3Q3KNV8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCGF3Q3KNV8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCGF3Q3KNV8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCGF3Q3KNV8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCGF3Q3KNV8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCGF3Q3KNV8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCGF3Q3KNV8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCGF3Q3KNV8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCGF3Q3KNV8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCGF3Q3KNV8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCGF3Q3KNV8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCGF3Q3KNV8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCGF3Q3KNV8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCGF3Q3KNV8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCGF3Q3KNV8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCGF3Q3KNV8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCGF3Q3KNV8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCGF3Q3KNV8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCGF3Q3KNV8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCGF3Q3KNV8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCGF3Q3KNV8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCGF3Q3KNV8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCGF3Q3KNV8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCGF3Q3KNV8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCGF3Q3KNV8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCGF3Q3KNV8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCGF3Q3KNV8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCGF3Q3KNV8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCGF3Q3KNV8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCGF3Q3KNV8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCGF3Q3KNV8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCGF3Q3KNV8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCGF3Q3KNV8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCGF3Q3KNV8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCGF3Q3KNV8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PCGF3Q3KNV8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCGF3Q3KNV8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCGF3Q3KNV8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCGF3Q3KNV8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCGF3Q3KNV8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCGF3Q3KNV8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF3Q3KNV8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF3Q3KNV8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCGF3Q3KNV8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCGF3Q3KNV8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCGF3Q3KNV8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PCGF3Q3KNV8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCGF3Q3KNV8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCGF3Q3KNV8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PCGF3Q3KNV8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCGF3Q3KNV8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCGF3Q3KNV8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCGF3Q3KNV8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCGF3Q3KNV8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCGF3Q3KNV8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCGF3Q3KNV8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCGF3Q3KNV8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCGF3Q3KNV8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCGF3Q3KNV8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCGF3Q3KNV8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCGF3Q3KNV8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCGF3Q3KNV8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCGF3Q3KNV8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCGF3Q3KNV8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCGF3Q3KNV8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCGF3Q3KNV8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCGF3Q3KNV8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCGF3Q3KNV8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms