Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPA4

CR1L, Complement component receptor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CR1LQ2VPA4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CR1LQ2VPA4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CR1LQ2VPA4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CR1LQ2VPA4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CR1LQ2VPA4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CR1LQ2VPA4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CR1LQ2VPA4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CR1LQ2VPA4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CR1LQ2VPA4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CR1LQ2VPA4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CR1LQ2VPA4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CR1LQ2VPA4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CR1LQ2VPA4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CR1LQ2VPA4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CR1LQ2VPA4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CR1LQ2VPA4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CR1LQ2VPA4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CR1LQ2VPA4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CR1LQ2VPA4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CR1LQ2VPA4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CR1LQ2VPA4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CR1LQ2VPA4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CR1LQ2VPA4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CR1LQ2VPA4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CR1LQ2VPA4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CR1LQ2VPA4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CR1LQ2VPA4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CR1LQ2VPA4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CR1LQ2VPA4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CR1LQ2VPA4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CR1LQ2VPA4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CR1LQ2VPA4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CR1LQ2VPA4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CR1LQ2VPA4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CR1LQ2VPA4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CR1LQ2VPA4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CR1LQ2VPA4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CR1LQ2VPA4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CR1LQ2VPA4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CR1LQ2VPA4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CR1LQ2VPA4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CR1LQ2VPA4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CR1LQ2VPA4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CR1LQ2VPA4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CR1LQ2VPA4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CR1LQ2VPA4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CR1LQ2VPA4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CR1LQ2VPA4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CR1LQ2VPA4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CR1LQ2VPA4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CR1LQ2VPA4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CR1LQ2VPA4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CR1LQ2VPA4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CR1LQ2VPA4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CR1LQ2VPA4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CR1LQ2VPA4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CR1LQ2VPA4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CR1LQ2VPA4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CR1LQ2VPA4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CR1LQ2VPA4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CR1LQ2VPA4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CR1LQ2VPA4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CR1LQ2VPA4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CR1LQ2VPA4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CR1LQ2VPA4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CR1LQ2VPA4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CR1LQ2VPA4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CR1LQ2VPA4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CR1LQ2VPA4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CR1LQ2VPA4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CR1LQ2VPA4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CR1LQ2VPA4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CR1LQ2VPA4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CR1LQ2VPA4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CR1LQ2VPA4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CR1LQ2VPA4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CR1LQ2VPA4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CR1LQ2VPA4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CR1LQ2VPA4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CR1LQ2VPA4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CR1LQ2VPA4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CR1LQ2VPA4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CR1LQ2VPA4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CR1LQ2VPA4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CR1LQ2VPA4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CR1LQ2VPA4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CR1LQ2VPA4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CR1LQ2VPA4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CR1LQ2VPA4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CR1LQ2VPA4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CR1LQ2VPA4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CR1LQ2VPA4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CR1LQ2VPA4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CR1LQ2VPA4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CR1LQ2VPA4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CR1LQ2VPA4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CR1LQ2VPA4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CR1LQ2VPA4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CR1LQ2VPA4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CR1LQ2VPA4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms