Protein–RNA interactions for Protein: Q2VIQ3

KIF4B, Chromosome-associated kinesin KIF4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4BQ2VIQ3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
KIF4BQ2VIQ3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
KIF4BQ2VIQ3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
KIF4BQ2VIQ3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
KIF4BQ2VIQ3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
KIF4BQ2VIQ3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
KIF4BQ2VIQ3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
KIF4BQ2VIQ3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
KIF4BQ2VIQ3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
KIF4BQ2VIQ3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC34.04■■■■□ 3.04
KIF4BQ2VIQ3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
KIF4BQ2VIQ3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
KIF4BQ2VIQ3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
KIF4BQ2VIQ3 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
KIF4BQ2VIQ3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
KIF4BQ2VIQ3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
KIF4BQ2VIQ3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
KIF4BQ2VIQ3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
KIF4BQ2VIQ3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
KIF4BQ2VIQ3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
KIF4BQ2VIQ3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
KIF4BQ2VIQ3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
KIF4BQ2VIQ3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
KIF4BQ2VIQ3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
KIF4BQ2VIQ3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
KIF4BQ2VIQ3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
KIF4BQ2VIQ3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
KIF4BQ2VIQ3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
KIF4BQ2VIQ3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
KIF4BQ2VIQ3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC33.82■■■■□ 3
KIF4BQ2VIQ3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
KIF4BQ2VIQ3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
KIF4BQ2VIQ3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
KIF4BQ2VIQ3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC33.78■■■■□ 3
KIF4BQ2VIQ3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC33.77■■■■□ 3
KIF4BQ2VIQ3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
KIF4BQ2VIQ3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
KIF4BQ2VIQ3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
KIF4BQ2VIQ3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
KIF4BQ2VIQ3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
KIF4BQ2VIQ3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
KIF4BQ2VIQ3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
KIF4BQ2VIQ3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
KIF4BQ2VIQ3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
KIF4BQ2VIQ3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
KIF4BQ2VIQ3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
KIF4BQ2VIQ3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
KIF4BQ2VIQ3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
KIF4BQ2VIQ3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
KIF4BQ2VIQ3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
KIF4BQ2VIQ3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
KIF4BQ2VIQ3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
KIF4BQ2VIQ3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
KIF4BQ2VIQ3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
KIF4BQ2VIQ3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
KIF4BQ2VIQ3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
KIF4BQ2VIQ3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
KIF4BQ2VIQ3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
KIF4BQ2VIQ3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
KIF4BQ2VIQ3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
KIF4BQ2VIQ3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
KIF4BQ2VIQ3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
KIF4BQ2VIQ3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
KIF4BQ2VIQ3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
KIF4BQ2VIQ3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
KIF4BQ2VIQ3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
KIF4BQ2VIQ3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
KIF4BQ2VIQ3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
KIF4BQ2VIQ3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
KIF4BQ2VIQ3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
KIF4BQ2VIQ3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
KIF4BQ2VIQ3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
KIF4BQ2VIQ3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
KIF4BQ2VIQ3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
KIF4BQ2VIQ3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
KIF4BQ2VIQ3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
KIF4BQ2VIQ3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
KIF4BQ2VIQ3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
KIF4BQ2VIQ3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
KIF4BQ2VIQ3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
KIF4BQ2VIQ3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
KIF4BQ2VIQ3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
KIF4BQ2VIQ3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
KIF4BQ2VIQ3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
KIF4BQ2VIQ3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
KIF4BQ2VIQ3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
KIF4BQ2VIQ3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
KIF4BQ2VIQ3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
KIF4BQ2VIQ3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
KIF4BQ2VIQ3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
KIF4BQ2VIQ3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
KIF4BQ2VIQ3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
KIF4BQ2VIQ3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
KIF4BQ2VIQ3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
KIF4BQ2VIQ3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
KIF4BQ2VIQ3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
KIF4BQ2VIQ3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
KIF4BQ2VIQ3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
KIF4BQ2VIQ3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
KIF4BQ2VIQ3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms