Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RRN3P1Q2M238 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RRN3P1Q2M238 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RRN3P1Q2M238 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RRN3P1Q2M238 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RRN3P1Q2M238 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RRN3P1Q2M238 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RRN3P1Q2M238 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RRN3P1Q2M238 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RRN3P1Q2M238 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RRN3P1Q2M238 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RRN3P1Q2M238 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RRN3P1Q2M238 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RRN3P1Q2M238 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RRN3P1Q2M238 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RRN3P1Q2M238 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RRN3P1Q2M238 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RRN3P1Q2M238 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RRN3P1Q2M238 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RRN3P1Q2M238 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RRN3P1Q2M238 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RRN3P1Q2M238 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RRN3P1Q2M238 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RRN3P1Q2M238 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RRN3P1Q2M238 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RRN3P1Q2M238 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RRN3P1Q2M238 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RRN3P1Q2M238 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RRN3P1Q2M238 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RRN3P1Q2M238 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RRN3P1Q2M238 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RRN3P1Q2M238 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RRN3P1Q2M238 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RRN3P1Q2M238 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RRN3P1Q2M238 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RRN3P1Q2M238 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RRN3P1Q2M238 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RRN3P1Q2M238 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RRN3P1Q2M238 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RRN3P1Q2M238 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RRN3P1Q2M238 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RRN3P1Q2M238 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RRN3P1Q2M238 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RRN3P1Q2M238 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RRN3P1Q2M238 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RRN3P1Q2M238 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RRN3P1Q2M238 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RRN3P1Q2M238 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RRN3P1Q2M238 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RRN3P1Q2M238 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RRN3P1Q2M238 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RRN3P1Q2M238 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RRN3P1Q2M238 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RRN3P1Q2M238 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RRN3P1Q2M238 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RRN3P1Q2M238 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RRN3P1Q2M238 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RRN3P1Q2M238 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RRN3P1Q2M238 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RRN3P1Q2M238 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RRN3P1Q2M238 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RRN3P1Q2M238 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RRN3P1Q2M238 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RRN3P1Q2M238 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RRN3P1Q2M238 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RRN3P1Q2M238 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RRN3P1Q2M238 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RRN3P1Q2M238 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RRN3P1Q2M238 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RRN3P1Q2M238 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RRN3P1Q2M238 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RRN3P1Q2M238 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RRN3P1Q2M238 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RRN3P1Q2M238 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RRN3P1Q2M238 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RRN3P1Q2M238 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RRN3P1Q2M238 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RRN3P1Q2M238 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RRN3P1Q2M238 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RRN3P1Q2M238 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RRN3P1Q2M238 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RRN3P1Q2M238 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RRN3P1Q2M238 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RRN3P1Q2M238 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RRN3P1Q2M238 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RRN3P1Q2M238 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RRN3P1Q2M238 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RRN3P1Q2M238 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RRN3P1Q2M238 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RRN3P1Q2M238 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RRN3P1Q2M238 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RRN3P1Q2M238 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RRN3P1Q2M238 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RRN3P1Q2M238 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RRN3P1Q2M238 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RRN3P1Q2M238 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RRN3P1Q2M238 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RRN3P1Q2M238 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RRN3P1Q2M238 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RRN3P1Q2M238 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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