Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

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Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RRN3P1Q2M238 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRN3P1Q2M238 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RRN3P1Q2M238 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RRN3P1Q2M238 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRN3P1Q2M238 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRN3P1Q2M238 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRN3P1Q2M238 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRN3P1Q2M238 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRN3P1Q2M238 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRN3P1Q2M238 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRN3P1Q2M238 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRN3P1Q2M238 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRN3P1Q2M238 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRN3P1Q2M238 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRN3P1Q2M238 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRN3P1Q2M238 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRN3P1Q2M238 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRN3P1Q2M238 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRN3P1Q2M238 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RRN3P1Q2M238 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRN3P1Q2M238 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRN3P1Q2M238 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRN3P1Q2M238 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRN3P1Q2M238 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRN3P1Q2M238 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRN3P1Q2M238 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRN3P1Q2M238 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRN3P1Q2M238 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRN3P1Q2M238 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRN3P1Q2M238 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRN3P1Q2M238 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRN3P1Q2M238 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRN3P1Q2M238 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRN3P1Q2M238 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRN3P1Q2M238 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRN3P1Q2M238 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRN3P1Q2M238 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRN3P1Q2M238 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRN3P1Q2M238 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRN3P1Q2M238 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRN3P1Q2M238 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRN3P1Q2M238 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRN3P1Q2M238 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRN3P1Q2M238 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRN3P1Q2M238 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRN3P1Q2M238 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRN3P1Q2M238 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRN3P1Q2M238 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRN3P1Q2M238 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRN3P1Q2M238 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRN3P1Q2M238 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRN3P1Q2M238 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRN3P1Q2M238 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRN3P1Q2M238 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRN3P1Q2M238 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRN3P1Q2M238 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRN3P1Q2M238 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RRN3P1Q2M238 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RRN3P1Q2M238 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RRN3P1Q2M238 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RRN3P1Q2M238 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RRN3P1Q2M238 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RRN3P1Q2M238 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RRN3P1Q2M238 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RRN3P1Q2M238 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRN3P1Q2M238 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RRN3P1Q2M238 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RRN3P1Q2M238 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RRN3P1Q2M238 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRN3P1Q2M238 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRN3P1Q2M238 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRN3P1Q2M238 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRN3P1Q2M238 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRN3P1Q2M238 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRN3P1Q2M238 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RRN3P1Q2M238 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RRN3P1Q2M238 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RRN3P1Q2M238 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRN3P1Q2M238 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRN3P1Q2M238 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RRN3P1Q2M238 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRN3P1Q2M238 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRN3P1Q2M238 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRN3P1Q2M238 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RRN3P1Q2M238 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RRN3P1Q2M238 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RRN3P1Q2M238 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RRN3P1Q2M238 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RRN3P1Q2M238 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RRN3P1Q2M238 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RRN3P1Q2M238 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RRN3P1Q2M238 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RRN3P1Q2M238 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RRN3P1Q2M238 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RRN3P1Q2M238 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RRN3P1Q2M238 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RRN3P1Q2M238 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RRN3P1Q2M238 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RRN3P1Q2M238 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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