Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
FOXD1Q16676 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC41.11■■■■■ 4.17
FOXD1Q16676 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC41.11■■■■■ 4.17
FOXD1Q16676 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
FOXD1Q16676 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
FOXD1Q16676 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
FOXD1Q16676 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
FOXD1Q16676 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC41.07■■■■■ 4.17
FOXD1Q16676 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
FOXD1Q16676 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
FOXD1Q16676 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.16
FOXD1Q16676 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
FOXD1Q16676 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
FOXD1Q16676 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC40.91■■■■■ 4.14
FOXD1Q16676 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
FOXD1Q16676 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC40.9■■■■■ 4.14
FOXD1Q16676 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
FOXD1Q16676 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
FOXD1Q16676 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
FOXD1Q16676 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.13
FOXD1Q16676 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.13
FOXD1Q16676 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC40.87■■■■■ 4.13
FOXD1Q16676 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
FOXD1Q16676 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC40.82■■■■■ 4.13
FOXD1Q16676 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.82■■■■■ 4.12
FOXD1Q16676 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
FOXD1Q16676 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
FOXD1Q16676 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
FOXD1Q16676 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC40.76■■■■■ 4.12
FOXD1Q16676 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
FOXD1Q16676 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
FOXD1Q16676 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
FOXD1Q16676 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
FOXD1Q16676 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC40.7■■■■■ 4.11
FOXD1Q16676 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
FOXD1Q16676 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
FOXD1Q16676 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
FOXD1Q16676 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.67■■■■■ 4.1
FOXD1Q16676 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
FOXD1Q16676 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC40.67■■■■■ 4.1
FOXD1Q16676 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
FOXD1Q16676 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
FOXD1Q16676 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
FOXD1Q16676 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
FOXD1Q16676 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
FOXD1Q16676 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
FOXD1Q16676 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
FOXD1Q16676 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
FOXD1Q16676 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
FOXD1Q16676 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.09
FOXD1Q16676 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC40.52■■■■■ 4.08
FOXD1Q16676 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC40.52■■■■■ 4.08
FOXD1Q16676 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
FOXD1Q16676 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
FOXD1Q16676 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
FOXD1Q16676 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
FOXD1Q16676 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.49■■■■■ 4.07
FOXD1Q16676 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC40.48■■■■■ 4.07
FOXD1Q16676 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
FOXD1Q16676 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
FOXD1Q16676 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
FOXD1Q16676 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
FOXD1Q16676 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
FOXD1Q16676 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
FOXD1Q16676 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
FOXD1Q16676 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
FOXD1Q16676 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC40.36■■■■■ 4.05
FOXD1Q16676 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
FOXD1Q16676 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
FOXD1Q16676 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
FOXD1Q16676 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
FOXD1Q16676 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
FOXD1Q16676 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
FOXD1Q16676 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
FOXD1Q16676 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
FOXD1Q16676 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
FOXD1Q16676 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
FOXD1Q16676 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
FOXD1Q16676 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
FOXD1Q16676 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.28■■■■■ 4.04
FOXD1Q16676 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
FOXD1Q16676 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
FOXD1Q16676 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
FOXD1Q16676 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
FOXD1Q16676 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
FOXD1Q16676 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
FOXD1Q16676 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
FOXD1Q16676 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
FOXD1Q16676 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC40.2■■■■■ 4.03
FOXD1Q16676 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
FOXD1Q16676 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
FOXD1Q16676 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
FOXD1Q16676 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
FOXD1Q16676 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
FOXD1Q16676 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC40.14■■■■■ 4.02
FOXD1Q16676 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC40.14■■■■■ 4.02
FOXD1Q16676 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
FOXD1Q16676 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
FOXD1Q16676 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
FOXD1Q16676 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms