Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
DDB1Q16531 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
DDB1Q16531 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
DDB1Q16531 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
DDB1Q16531 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
DDB1Q16531 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
DDB1Q16531 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
DDB1Q16531 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
DDB1Q16531 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
DDB1Q16531 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
DDB1Q16531 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
DDB1Q16531 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC37.45■■■■□ 3.59
DDB1Q16531 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
DDB1Q16531 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
DDB1Q16531 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
DDB1Q16531 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
DDB1Q16531 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
DDB1Q16531 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
DDB1Q16531 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
DDB1Q16531 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
DDB1Q16531 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
DDB1Q16531 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
DDB1Q16531 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.56
DDB1Q16531 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
DDB1Q16531 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
DDB1Q16531 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
DDB1Q16531 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
DDB1Q16531 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
DDB1Q16531 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
DDB1Q16531 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
DDB1Q16531 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
DDB1Q16531 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
DDB1Q16531 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
DDB1Q16531 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
DDB1Q16531 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
DDB1Q16531 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.54
DDB1Q16531 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
DDB1Q16531 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
DDB1Q16531 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC37.16■■■■□ 3.54
DDB1Q16531 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
DDB1Q16531 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
DDB1Q16531 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
DDB1Q16531 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
DDB1Q16531 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
DDB1Q16531 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
DDB1Q16531 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
DDB1Q16531 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
DDB1Q16531 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
DDB1Q16531 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
DDB1Q16531 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
DDB1Q16531 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
DDB1Q16531 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
DDB1Q16531 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
DDB1Q16531 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
DDB1Q16531 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
DDB1Q16531 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
DDB1Q16531 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
DDB1Q16531 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
DDB1Q16531 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
DDB1Q16531 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
DDB1Q16531 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
DDB1Q16531 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
DDB1Q16531 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
DDB1Q16531 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
DDB1Q16531 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
DDB1Q16531 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
DDB1Q16531 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
DDB1Q16531 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
DDB1Q16531 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
DDB1Q16531 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
DDB1Q16531 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.48
DDB1Q16531 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
DDB1Q16531 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
DDB1Q16531 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
DDB1Q16531 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
DDB1Q16531 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
DDB1Q16531 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
DDB1Q16531 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
DDB1Q16531 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
DDB1Q16531 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
DDB1Q16531 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
DDB1Q16531 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
DDB1Q16531 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
DDB1Q16531 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
DDB1Q16531 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
DDB1Q16531 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
DDB1Q16531 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
DDB1Q16531 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
DDB1Q16531 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
DDB1Q16531 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
DDB1Q16531 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
DDB1Q16531 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
DDB1Q16531 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
DDB1Q16531 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
DDB1Q16531 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
DDB1Q16531 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC36.58■■■■□ 3.45
DDB1Q16531 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
DDB1Q16531 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
DDB1Q16531 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
DDB1Q16531 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
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