Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GABRA6Q16445 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABRA6Q16445 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABRA6Q16445 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABRA6Q16445 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABRA6Q16445 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABRA6Q16445 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABRA6Q16445 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABRA6Q16445 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABRA6Q16445 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABRA6Q16445 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABRA6Q16445 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABRA6Q16445 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABRA6Q16445 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABRA6Q16445 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRA6Q16445 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRA6Q16445 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRA6Q16445 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRA6Q16445 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRA6Q16445 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABRA6Q16445 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABRA6Q16445 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABRA6Q16445 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GABRA6Q16445 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABRA6Q16445 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABRA6Q16445 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GABRA6Q16445 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABRA6Q16445 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABRA6Q16445 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GABRA6Q16445 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABRA6Q16445 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABRA6Q16445 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABRA6Q16445 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABRA6Q16445 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABRA6Q16445 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABRA6Q16445 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABRA6Q16445 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABRA6Q16445 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABRA6Q16445 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GABRA6Q16445 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GABRA6Q16445 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GABRA6Q16445 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GABRA6Q16445 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GABRA6Q16445 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABRA6Q16445 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABRA6Q16445 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABRA6Q16445 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABRA6Q16445 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABRA6Q16445 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABRA6Q16445 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABRA6Q16445 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GABRA6Q16445 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GABRA6Q16445 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GABRA6Q16445 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GABRA6Q16445 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GABRA6Q16445 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GABRA6Q16445 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GABRA6Q16445 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABRA6Q16445 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GABRA6Q16445 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABRA6Q16445 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABRA6Q16445 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABRA6Q16445 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABRA6Q16445 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABRA6Q16445 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABRA6Q16445 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GABRA6Q16445 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
GABRA6Q16445 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABRA6Q16445 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GABRA6Q16445 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABRA6Q16445 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GABRA6Q16445 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GABRA6Q16445 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GABRA6Q16445 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GABRA6Q16445 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABRA6Q16445 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABRA6Q16445 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABRA6Q16445 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GABRA6Q16445 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GABRA6Q16445 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GABRA6Q16445 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABRA6Q16445 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABRA6Q16445 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABRA6Q16445 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABRA6Q16445 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABRA6Q16445 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABRA6Q16445 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABRA6Q16445 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GABRA6Q16445 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABRA6Q16445 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GABRA6Q16445 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GABRA6Q16445 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABRA6Q16445 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABRA6Q16445 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABRA6Q16445 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABRA6Q16445 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABRA6Q16445 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABRA6Q16445 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABRA6Q16445 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABRA6Q16445 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
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