Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC6Q16204 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC6Q16204 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC6Q16204 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC6Q16204 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC6Q16204 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC6Q16204 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC6Q16204 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC6Q16204 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC6Q16204 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC6Q16204 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC6Q16204 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC6Q16204 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC6Q16204 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC6Q16204 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC6Q16204 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC6Q16204 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC6Q16204 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC6Q16204 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC6Q16204 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC6Q16204 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC6Q16204 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC6Q16204 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC6Q16204 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC6Q16204 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC6Q16204 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC6Q16204 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC6Q16204 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC6Q16204 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC6Q16204 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC6Q16204 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC6Q16204 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC6Q16204 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC6Q16204 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC6Q16204 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC6Q16204 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC6Q16204 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC6Q16204 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC6Q16204 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC6Q16204 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC6Q16204 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC6Q16204 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC6Q16204 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC6Q16204 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC6Q16204 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC6Q16204 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC6Q16204 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC6Q16204 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC6Q16204 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC6Q16204 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC6Q16204 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC6Q16204 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC6Q16204 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC6Q16204 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC6Q16204 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC6Q16204 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC6Q16204 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC6Q16204 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC6Q16204 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC6Q16204 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC6Q16204 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC6Q16204 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC6Q16204 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC6Q16204 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC6Q16204 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC6Q16204 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC6Q16204 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC6Q16204 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC6Q16204 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC6Q16204 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC6Q16204 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC6Q16204 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC6Q16204 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC6Q16204 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC6Q16204 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC6Q16204 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC6Q16204 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC6Q16204 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC6Q16204 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC6Q16204 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC6Q16204 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC6Q16204 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC6Q16204 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC6Q16204 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC6Q16204 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC6Q16204 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC6Q16204 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC6Q16204 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC6Q16204 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC6Q16204 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC6Q16204 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC6Q16204 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC6Q16204 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC6Q16204 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC6Q16204 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC6Q16204 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC6Q16204 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC6Q16204 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC6Q16204 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC6Q16204 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
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