Protein–RNA interactions for Protein: Q16134

ETFDH, Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFDHQ16134 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ETFDHQ16134 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ETFDHQ16134 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ETFDHQ16134 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ETFDHQ16134 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ETFDHQ16134 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ETFDHQ16134 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ETFDHQ16134 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ETFDHQ16134 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ETFDHQ16134 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ETFDHQ16134 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ETFDHQ16134 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ETFDHQ16134 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ETFDHQ16134 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ETFDHQ16134 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ETFDHQ16134 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ETFDHQ16134 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ETFDHQ16134 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ETFDHQ16134 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ETFDHQ16134 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ETFDHQ16134 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ETFDHQ16134 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ETFDHQ16134 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ETFDHQ16134 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ETFDHQ16134 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ETFDHQ16134 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ETFDHQ16134 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ETFDHQ16134 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ETFDHQ16134 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ETFDHQ16134 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ETFDHQ16134 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ETFDHQ16134 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ETFDHQ16134 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ETFDHQ16134 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ETFDHQ16134 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ETFDHQ16134 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ETFDHQ16134 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ETFDHQ16134 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ETFDHQ16134 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ETFDHQ16134 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ETFDHQ16134 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ETFDHQ16134 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ETFDHQ16134 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ETFDHQ16134 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ETFDHQ16134 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ETFDHQ16134 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ETFDHQ16134 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ETFDHQ16134 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ETFDHQ16134 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ETFDHQ16134 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ETFDHQ16134 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ETFDHQ16134 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ETFDHQ16134 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ETFDHQ16134 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ETFDHQ16134 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ETFDHQ16134 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ETFDHQ16134 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ETFDHQ16134 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ETFDHQ16134 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ETFDHQ16134 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ETFDHQ16134 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ETFDHQ16134 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ETFDHQ16134 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ETFDHQ16134 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ETFDHQ16134 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ETFDHQ16134 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ETFDHQ16134 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ETFDHQ16134 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ETFDHQ16134 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ETFDHQ16134 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ETFDHQ16134 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ETFDHQ16134 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ETFDHQ16134 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ETFDHQ16134 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ETFDHQ16134 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ETFDHQ16134 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ETFDHQ16134 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ETFDHQ16134 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ETFDHQ16134 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ETFDHQ16134 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ETFDHQ16134 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ETFDHQ16134 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ETFDHQ16134 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ETFDHQ16134 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ETFDHQ16134 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ETFDHQ16134 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ETFDHQ16134 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ETFDHQ16134 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ETFDHQ16134 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ETFDHQ16134 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ETFDHQ16134 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ETFDHQ16134 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ETFDHQ16134 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ETFDHQ16134 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ETFDHQ16134 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ETFDHQ16134 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ETFDHQ16134 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ETFDHQ16134 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ETFDHQ16134 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ETFDHQ16134 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms