Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CHRNA2Q15822 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
CHRNA2Q15822 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
CHRNA2Q15822 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
CHRNA2Q15822 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.71
CHRNA2Q15822 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
CHRNA2Q15822 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
CHRNA2Q15822 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
CHRNA2Q15822 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
CHRNA2Q15822 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
CHRNA2Q15822 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
CHRNA2Q15822 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
CHRNA2Q15822 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
CHRNA2Q15822 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC38.09■■■■□ 3.69
CHRNA2Q15822 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
CHRNA2Q15822 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
CHRNA2Q15822 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CHRNA2Q15822 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
CHRNA2Q15822 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
CHRNA2Q15822 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
CHRNA2Q15822 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CHRNA2Q15822 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
CHRNA2Q15822 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
CHRNA2Q15822 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
CHRNA2Q15822 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
CHRNA2Q15822 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
CHRNA2Q15822 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CHRNA2Q15822 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
CHRNA2Q15822 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
CHRNA2Q15822 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
CHRNA2Q15822 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
CHRNA2Q15822 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
CHRNA2Q15822 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
CHRNA2Q15822 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CHRNA2Q15822 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CHRNA2Q15822 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CHRNA2Q15822 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CHRNA2Q15822 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CHRNA2Q15822 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
CHRNA2Q15822 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC37.8■■■■□ 3.64
CHRNA2Q15822 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC37.8■■■■□ 3.64
CHRNA2Q15822 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CHRNA2Q15822 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
CHRNA2Q15822 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
CHRNA2Q15822 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CHRNA2Q15822 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
CHRNA2Q15822 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
CHRNA2Q15822 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
CHRNA2Q15822 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
CHRNA2Q15822 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
CHRNA2Q15822 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
CHRNA2Q15822 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
CHRNA2Q15822 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
CHRNA2Q15822 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
CHRNA2Q15822 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
CHRNA2Q15822 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
CHRNA2Q15822 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
CHRNA2Q15822 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
CHRNA2Q15822 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
CHRNA2Q15822 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
CHRNA2Q15822 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
CHRNA2Q15822 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CHRNA2Q15822 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CHRNA2Q15822 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
CHRNA2Q15822 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CHRNA2Q15822 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
CHRNA2Q15822 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
CHRNA2Q15822 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
CHRNA2Q15822 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
CHRNA2Q15822 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
CHRNA2Q15822 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
CHRNA2Q15822 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CHRNA2Q15822 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
CHRNA2Q15822 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CHRNA2Q15822 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
CHRNA2Q15822 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC37.42■■■■□ 3.58
CHRNA2Q15822 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC37.42■■■■□ 3.58
CHRNA2Q15822 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
CHRNA2Q15822 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
CHRNA2Q15822 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
CHRNA2Q15822 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
CHRNA2Q15822 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC37.38■■■■□ 3.57
CHRNA2Q15822 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
CHRNA2Q15822 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
CHRNA2Q15822 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
CHRNA2Q15822 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
CHRNA2Q15822 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CHRNA2Q15822 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CHRNA2Q15822 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
CHRNA2Q15822 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
CHRNA2Q15822 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
CHRNA2Q15822 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
CHRNA2Q15822 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
CHRNA2Q15822 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
CHRNA2Q15822 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.56
CHRNA2Q15822 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
CHRNA2Q15822 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CHRNA2Q15822 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CHRNA2Q15822 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CHRNA2Q15822 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms