Protein–RNA interactions for Protein: Q15643

TRIP11, Thyroid receptor-interacting protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP11Q15643 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TRIP11Q15643 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TRIP11Q15643 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TRIP11Q15643 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TRIP11Q15643 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TRIP11Q15643 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
TRIP11Q15643 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
TRIP11Q15643 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
TRIP11Q15643 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TRIP11Q15643 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TRIP11Q15643 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
TRIP11Q15643 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TRIP11Q15643 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TRIP11Q15643 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TRIP11Q15643 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TRIP11Q15643 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
TRIP11Q15643 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRIP11Q15643 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRIP11Q15643 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
TRIP11Q15643 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRIP11Q15643 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRIP11Q15643 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRIP11Q15643 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRIP11Q15643 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRIP11Q15643 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TRIP11Q15643 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRIP11Q15643 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRIP11Q15643 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
TRIP11Q15643 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
TRIP11Q15643 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
TRIP11Q15643 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRIP11Q15643 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRIP11Q15643 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRIP11Q15643 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRIP11Q15643 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRIP11Q15643 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRIP11Q15643 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRIP11Q15643 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRIP11Q15643 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRIP11Q15643 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRIP11Q15643 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
TRIP11Q15643 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIP11Q15643 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIP11Q15643 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIP11Q15643 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRIP11Q15643 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIP11Q15643 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIP11Q15643 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIP11Q15643 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRIP11Q15643 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRIP11Q15643 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRIP11Q15643 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
TRIP11Q15643 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
TRIP11Q15643 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRIP11Q15643 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRIP11Q15643 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRIP11Q15643 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRIP11Q15643 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRIP11Q15643 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRIP11Q15643 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRIP11Q15643 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRIP11Q15643 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRIP11Q15643 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRIP11Q15643 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRIP11Q15643 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRIP11Q15643 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRIP11Q15643 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRIP11Q15643 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRIP11Q15643 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRIP11Q15643 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRIP11Q15643 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRIP11Q15643 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRIP11Q15643 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TRIP11Q15643 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRIP11Q15643 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIP11Q15643 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIP11Q15643 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRIP11Q15643 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRIP11Q15643 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRIP11Q15643 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRIP11Q15643 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRIP11Q15643 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRIP11Q15643 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRIP11Q15643 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIP11Q15643 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIP11Q15643 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIP11Q15643 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIP11Q15643 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRIP11Q15643 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRIP11Q15643 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRIP11Q15643 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIP11Q15643 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIP11Q15643 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRIP11Q15643 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRIP11Q15643 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRIP11Q15643 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRIP11Q15643 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRIP11Q15643 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRIP11Q15643 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRIP11Q15643 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms