Protein–RNA interactions for Protein: Q15406

NR6A1, Nuclear receptor subfamily 6 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR6A1Q15406 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NR6A1Q15406 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NR6A1Q15406 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NR6A1Q15406 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NR6A1Q15406 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NR6A1Q15406 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NR6A1Q15406 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NR6A1Q15406 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NR6A1Q15406 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NR6A1Q15406 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NR6A1Q15406 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NR6A1Q15406 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NR6A1Q15406 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NR6A1Q15406 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NR6A1Q15406 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NR6A1Q15406 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NR6A1Q15406 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NR6A1Q15406 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NR6A1Q15406 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NR6A1Q15406 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NR6A1Q15406 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NR6A1Q15406 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NR6A1Q15406 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NR6A1Q15406 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NR6A1Q15406 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NR6A1Q15406 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NR6A1Q15406 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NR6A1Q15406 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NR6A1Q15406 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NR6A1Q15406 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NR6A1Q15406 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NR6A1Q15406 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NR6A1Q15406 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NR6A1Q15406 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NR6A1Q15406 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NR6A1Q15406 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NR6A1Q15406 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NR6A1Q15406 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NR6A1Q15406 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NR6A1Q15406 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NR6A1Q15406 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NR6A1Q15406 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NR6A1Q15406 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NR6A1Q15406 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NR6A1Q15406 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NR6A1Q15406 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NR6A1Q15406 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NR6A1Q15406 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NR6A1Q15406 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NR6A1Q15406 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NR6A1Q15406 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NR6A1Q15406 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NR6A1Q15406 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NR6A1Q15406 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NR6A1Q15406 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NR6A1Q15406 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NR6A1Q15406 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NR6A1Q15406 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NR6A1Q15406 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NR6A1Q15406 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NR6A1Q15406 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NR6A1Q15406 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NR6A1Q15406 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NR6A1Q15406 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NR6A1Q15406 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NR6A1Q15406 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NR6A1Q15406 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NR6A1Q15406 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NR6A1Q15406 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NR6A1Q15406 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NR6A1Q15406 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NR6A1Q15406 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NR6A1Q15406 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NR6A1Q15406 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NR6A1Q15406 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NR6A1Q15406 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NR6A1Q15406 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NR6A1Q15406 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NR6A1Q15406 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NR6A1Q15406 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NR6A1Q15406 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NR6A1Q15406 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NR6A1Q15406 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NR6A1Q15406 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NR6A1Q15406 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NR6A1Q15406 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NR6A1Q15406 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NR6A1Q15406 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NR6A1Q15406 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NR6A1Q15406 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NR6A1Q15406 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NR6A1Q15406 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NR6A1Q15406 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NR6A1Q15406 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NR6A1Q15406 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NR6A1Q15406 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NR6A1Q15406 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NR6A1Q15406 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NR6A1Q15406 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NR6A1Q15406 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms