Protein–RNA interactions for Protein: Q15406

NR6A1, Nuclear receptor subfamily 6 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR6A1Q15406 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NR6A1Q15406 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NR6A1Q15406 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
NR6A1Q15406 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
NR6A1Q15406 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
NR6A1Q15406 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NR6A1Q15406 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
NR6A1Q15406 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NR6A1Q15406 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
NR6A1Q15406 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
NR6A1Q15406 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NR6A1Q15406 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
NR6A1Q15406 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NR6A1Q15406 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NR6A1Q15406 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NR6A1Q15406 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
NR6A1Q15406 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NR6A1Q15406 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
NR6A1Q15406 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NR6A1Q15406 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NR6A1Q15406 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
NR6A1Q15406 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NR6A1Q15406 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NR6A1Q15406 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NR6A1Q15406 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NR6A1Q15406 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NR6A1Q15406 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NR6A1Q15406 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NR6A1Q15406 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NR6A1Q15406 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NR6A1Q15406 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NR6A1Q15406 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NR6A1Q15406 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NR6A1Q15406 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NR6A1Q15406 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NR6A1Q15406 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NR6A1Q15406 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NR6A1Q15406 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NR6A1Q15406 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NR6A1Q15406 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NR6A1Q15406 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NR6A1Q15406 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NR6A1Q15406 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NR6A1Q15406 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NR6A1Q15406 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NR6A1Q15406 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NR6A1Q15406 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NR6A1Q15406 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NR6A1Q15406 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NR6A1Q15406 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NR6A1Q15406 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NR6A1Q15406 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NR6A1Q15406 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NR6A1Q15406 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NR6A1Q15406 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NR6A1Q15406 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NR6A1Q15406 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NR6A1Q15406 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NR6A1Q15406 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NR6A1Q15406 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NR6A1Q15406 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NR6A1Q15406 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NR6A1Q15406 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NR6A1Q15406 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NR6A1Q15406 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NR6A1Q15406 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NR6A1Q15406 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NR6A1Q15406 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NR6A1Q15406 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NR6A1Q15406 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NR6A1Q15406 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NR6A1Q15406 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NR6A1Q15406 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NR6A1Q15406 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NR6A1Q15406 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NR6A1Q15406 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NR6A1Q15406 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NR6A1Q15406 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NR6A1Q15406 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NR6A1Q15406 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NR6A1Q15406 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NR6A1Q15406 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NR6A1Q15406 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NR6A1Q15406 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NR6A1Q15406 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NR6A1Q15406 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NR6A1Q15406 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NR6A1Q15406 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NR6A1Q15406 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NR6A1Q15406 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NR6A1Q15406 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NR6A1Q15406 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NR6A1Q15406 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NR6A1Q15406 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NR6A1Q15406 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NR6A1Q15406 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NR6A1Q15406 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NR6A1Q15406 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NR6A1Q15406 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NR6A1Q15406 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
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