Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDCD1Q15116 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDCD1Q15116 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDCD1Q15116 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDCD1Q15116 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDCD1Q15116 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDCD1Q15116 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDCD1Q15116 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDCD1Q15116 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDCD1Q15116 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCD1Q15116 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCD1Q15116 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDCD1Q15116 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDCD1Q15116 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCD1Q15116 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCD1Q15116 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCD1Q15116 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCD1Q15116 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCD1Q15116 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCD1Q15116 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCD1Q15116 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDCD1Q15116 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDCD1Q15116 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDCD1Q15116 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDCD1Q15116 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCD1Q15116 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCD1Q15116 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCD1Q15116 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCD1Q15116 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCD1Q15116 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCD1Q15116 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCD1Q15116 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCD1Q15116 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCD1Q15116 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDCD1Q15116 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PDCD1Q15116 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDCD1Q15116 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDCD1Q15116 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCD1Q15116 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCD1Q15116 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCD1Q15116 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDCD1Q15116 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCD1Q15116 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCD1Q15116 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCD1Q15116 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCD1Q15116 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCD1Q15116 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCD1Q15116 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCD1Q15116 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCD1Q15116 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCD1Q15116 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCD1Q15116 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDCD1Q15116 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDCD1Q15116 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDCD1Q15116 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDCD1Q15116 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDCD1Q15116 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCD1Q15116 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCD1Q15116 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCD1Q15116 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCD1Q15116 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCD1Q15116 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCD1Q15116 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDCD1Q15116 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDCD1Q15116 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDCD1Q15116 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDCD1Q15116 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDCD1Q15116 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDCD1Q15116 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDCD1Q15116 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDCD1Q15116 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCD1Q15116 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCD1Q15116 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCD1Q15116 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCD1Q15116 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDCD1Q15116 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCD1Q15116 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCD1Q15116 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCD1Q15116 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCD1Q15116 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCD1Q15116 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDCD1Q15116 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDCD1Q15116 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCD1Q15116 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDCD1Q15116 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDCD1Q15116 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDCD1Q15116 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCD1Q15116 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCD1Q15116 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCD1Q15116 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCD1Q15116 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCD1Q15116 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCD1Q15116 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCD1Q15116 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCD1Q15116 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCD1Q15116 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCD1Q15116 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDCD1Q15116 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCD1Q15116 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCD1Q15116 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
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