Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

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Length 1,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PSME4Q14997 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PSME4Q14997 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PSME4Q14997 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PSME4Q14997 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PSME4Q14997 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PSME4Q14997 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PSME4Q14997 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
PSME4Q14997 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PSME4Q14997 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PSME4Q14997 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PSME4Q14997 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PSME4Q14997 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PSME4Q14997 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PSME4Q14997 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PSME4Q14997 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PSME4Q14997 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PSME4Q14997 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PSME4Q14997 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PSME4Q14997 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PSME4Q14997 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
PSME4Q14997 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PSME4Q14997 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PSME4Q14997 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PSME4Q14997 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PSME4Q14997 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PSME4Q14997 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PSME4Q14997 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PSME4Q14997 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PSME4Q14997 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PSME4Q14997 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PSME4Q14997 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PSME4Q14997 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PSME4Q14997 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PSME4Q14997 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PSME4Q14997 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PSME4Q14997 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PSME4Q14997 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3.01
PSME4Q14997 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PSME4Q14997 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC33.81■■■■□ 3
PSME4Q14997 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PSME4Q14997 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PSME4Q14997 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
PSME4Q14997 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PSME4Q14997 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PSME4Q14997 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PSME4Q14997 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PSME4Q14997 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PSME4Q14997 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC33.76■■■■□ 3
PSME4Q14997 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.76■■■■□ 3
PSME4Q14997 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
PSME4Q14997 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PSME4Q14997 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PSME4Q14997 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PSME4Q14997 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PSME4Q14997 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PSME4Q14997 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PSME4Q14997 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PSME4Q14997 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PSME4Q14997 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
PSME4Q14997 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PSME4Q14997 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PSME4Q14997 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PSME4Q14997 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PSME4Q14997 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PSME4Q14997 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PSME4Q14997 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PSME4Q14997 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
PSME4Q14997 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PSME4Q14997 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PSME4Q14997 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PSME4Q14997 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PSME4Q14997 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PSME4Q14997 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PSME4Q14997 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
PSME4Q14997 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PSME4Q14997 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PSME4Q14997 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PSME4Q14997 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PSME4Q14997 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PSME4Q14997 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PSME4Q14997 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PSME4Q14997 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
PSME4Q14997 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PSME4Q14997 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PSME4Q14997 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
PSME4Q14997 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PSME4Q14997 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PSME4Q14997 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PSME4Q14997 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PSME4Q14997 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PSME4Q14997 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PSME4Q14997 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
PSME4Q14997 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PSME4Q14997 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PSME4Q14997 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PSME4Q14997 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PSME4Q14997 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
PSME4Q14997 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PSME4Q14997 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
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