Protein–RNA interactions for Protein: Q14493

SLBP, Histone RNA hairpin-binding protein, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLBPQ14493 SUGP1-209ENST00000588731 2282 ntTSL 1 (best)15.22■□□□□ 0.039e-7■■■■□ 21.6
SLBPQ14493 SUGP1-206ENST00000587119 2177 ntTSL 215.09■□□□□ 0.019e-7■■■■□ 21.6
SLBPQ14493 SUGP1-210ENST00000589144 2066 ntTSL 1 (best)15.05■□□□□ 09e-7■■■■□ 21.6
SLBPQ14493 SUGP1-204ENST00000585763 826 ntTSL 514.95□□□□□ -0.029e-7■■■■□ 21.6
SLBPQ14493 GLYR1-207ENST00000587936 897 ntTSL 512.86□□□□□ -0.359e-7■■■■□ 21.6
SLBPQ14493 SUGP1-205ENST00000586387 626 ntTSL 312.56□□□□□ -0.49e-7■■■■□ 21.6
SLBPQ14493 SUGP1-201ENST00000247001 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.539e-7■■■■□ 21.6
SLBPQ14493 GLYR1-201ENST00000321919 3772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.549e-7■■■■□ 21.6
SLBPQ14493 GLYR1-202ENST00000436648 3466 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.629e-7■■■■□ 21.6
SLBPQ14493 GLYR1-210ENST00000589389 3606 ntTSL 1 (best)10.71□□□□□ -0.699e-7■■■■□ 21.6
SLBPQ14493 GLYR1-209ENST00000588732 3527 ntTSL 1 (best)9.62□□□□□ -0.879e-7■■■■□ 21.6
SLBPQ14493 SUGP1-213ENST00000591350 601 ntTSL 49.59□□□□□ -0.879e-7■■■■□ 21.6
SLBPQ14493 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC5.9□□□□□ -1.464e-11■■■■□ 21
SLBPQ14493 RSL1D1-204ENST00000571133 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91e-12■■■□□ 19.2
SLBPQ14493 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.086e-6■■■□□ 19.2
SLBPQ14493 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC6.22□□□□□ -1.411e-323■■■□□ 18.5
SLBPQ14493 GFM2-201ENST00000296805 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.771e-6■■■□□ 18.4
SLBPQ14493 GFM2-202ENST00000345239 2856 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -11e-6■■■□□ 18.4
SLBPQ14493 GFM2-207ENST00000509430 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.071e-6■■■□□ 18.4
SLBPQ14493 GFM2-210ENST00000515125 1125 ntTSL 36.1□□□□□ -1.431e-6■■■□□ 18.4
SLBPQ14493 THAP9-AS1-202ENST00000504520 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.542e-12■■■□□ 16
SLBPQ14493 SEC31A-218ENST00000506495 541 ntTSL 49.5□□□□□ -0.892e-12■■■□□ 16
SLBPQ14493 THAP9-AS1-208ENST00000508772 566 ntTSL 49.5□□□□□ -0.892e-12■■■□□ 16
SLBPQ14493 THAP9-AS1-204ENST00000504792 2577 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -12e-12■■■□□ 16
SLBPQ14493 SEC31A-220ENST00000507051 458 ntTSL 48.61□□□□□ -1.032e-12■■■□□ 16
SLBPQ14493 THAP9-AS1-210ENST00000511271 516 ntTSL 28.05□□□□□ -1.122e-12■■■□□ 16
SLBPQ14493 SEC31A-222ENST00000507676 551 ntTSL 47.15□□□□□ -1.262e-12■■■□□ 16
SLBPQ14493 THAP9-AS1-211ENST00000512932 971 ntTSL 27.01□□□□□ -1.292e-12■■■□□ 16
SLBPQ14493 SEC31A-211ENST00000503210 553 ntTSL 46.86□□□□□ -1.312e-12■■■□□ 16
SLBPQ14493 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.552e-12■■■□□ 16
SLBPQ14493 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.254e-8■■■□□ 15.8
SLBPQ14493 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.034e-8■■■□□ 15.8
SLBPQ14493 FPGS-207ENST00000460181 2206 ntTSL 1 (best)18.97■□□□□ 0.634e-8■■■□□ 15.8
SLBPQ14493 FPGS-208ENST00000467826 829 ntTSL 518.62■□□□□ 0.574e-8■■■□□ 15.8
SLBPQ14493 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.514e-8■■■□□ 15.8
SLBPQ14493 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.394e-8■■■□□ 15.8
SLBPQ14493 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.32e-9■■■□□ 15.1
SLBPQ14493 GMPR-203ENST00000543191 675 ntTSL 29.76□□□□□ -0.852e-9■■■□□ 15.1
SLBPQ14493 RPL17-201ENST00000578528 481 ntTSL 322.38■■□□□ 1.175e-6■■■□□ 15.1
SLBPQ14493 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.695e-6■■■□□ 15.1
SLBPQ14493 RPL17-218ENST00000583637 758 ntTSL 318.25■□□□□ 0.515e-6■■■□□ 15.1
SLBPQ14493 RPL17-202ENST00000578532 684 ntTSL 218.25■□□□□ 0.515e-6■■■□□ 15.1
SLBPQ14493 RPL17-206ENST00000579495 914 ntTSL 218.23■□□□□ 0.515e-6■■■□□ 15.1
SLBPQ14493 RPL17-209ENST00000580387 827 ntTSL 515.99■□□□□ 0.155e-6■■■□□ 15.1
SLBPQ14493 RPL17-221ENST00000615760 650 ntTSL 315.94■□□□□ 0.145e-6■■■□□ 15.1
SLBPQ14493 RPL17-223ENST00000618613 856 ntAPPRIS P1 TSL 315.78■□□□□ 0.125e-6■■■□□ 15.1
SLBPQ14493 RPL17-C18orf32-201ENST00000332968 948 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.535e-6■■■□□ 15.1
SLBPQ14493 RPL17-220ENST00000615479 586 ntTSL 511.33□□□□□ -0.65e-6■■■□□ 15.1
SLBPQ14493 RPL17-222ENST00000617346 795 ntTSL 59.53□□□□□ -0.885e-6■■■□□ 15.1
SLBPQ14493 RPL17-207ENST00000580210 705 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.895e-6■■■□□ 15.1
SLBPQ14493 RPL17-211ENST00000581305 593 ntTSL 59.45□□□□□ -0.95e-6■■■□□ 15.1
SLBPQ14493 RPL17-224ENST00000618619 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.95e-6■■■□□ 15.1
SLBPQ14493 RPL17-205ENST00000579408 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.955e-6■■■□□ 15.1
SLBPQ14493 RPL17-212ENST00000581373 584 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.095e-6■■■□□ 15.1
SLBPQ14493 RPL17-208ENST00000580261 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.265e-6■■■□□ 15.1
SLBPQ14493 RPL17-215ENST00000582782 562 ntTSL 36.97□□□□□ -1.295e-6■■■□□ 15.1
SLBPQ14493 RPL17-203ENST00000578966 563 ntTSL 1 (best)6.46□□□□□ -1.385e-6■■■□□ 15.1
SLBPQ14493 RPL17-217ENST00000583036 576 ntTSL 36.37□□□□□ -1.395e-6■■■□□ 15.1
SLBPQ14493 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC4.73□□□□□ -1.655e-6■■■□□ 15.1
SLBPQ14493 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.166e-11■■□□□ 14.4
SLBPQ14493 GAS5-222ENST00000451607 1007 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.686e-11■■□□□ 14.4
SLBPQ14493 GAS5-224ENST00000454068 688 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.96e-11■■□□□ 14.4
SLBPQ14493 GAS5-214ENST00000436656 822 ntTSL 38.94□□□□□ -0.986e-11■■□□□ 14.4
SLBPQ14493 GAS5-210ENST00000431268 1698 ntTSL 28.37□□□□□ -1.076e-11■■□□□ 14.4
SLBPQ14493 GAS5-219ENST00000449289 542 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.176e-11■■□□□ 14.4
SLBPQ14493 GAS5-220ENST00000449589 712 ntTSL 37.74□□□□□ -1.176e-11■■□□□ 14.4
SLBPQ14493 GAS5-228ENST00000456812 723 ntTSL 36.56□□□□□ -1.366e-11■■□□□ 14.4
SLBPQ14493 GAS5-206ENST00000422183 745 ntTSL 25.9□□□□□ -1.466e-11■■□□□ 14.4
SLBPQ14493 GAS5-225ENST00000454813 621 ntTSL 35.9□□□□□ -1.466e-11■■□□□ 14.4
SLBPQ14493 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.496e-11■■□□□ 14.4
SLBPQ14493 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.526e-11■■□□□ 14.4
SLBPQ14493 GAS5-207ENST00000422207 643 ntTSL 25.53□□□□□ -1.526e-11■■□□□ 14.4
SLBPQ14493 GAS5-201ENST00000412059 979 ntTSL 55.24□□□□□ -1.576e-11■■□□□ 14.4
SLBPQ14493 GAS5-217ENST00000444470 424 ntTSL 25.24□□□□□ -1.576e-11■■□□□ 14.4
SLBPQ14493 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.66e-11■■□□□ 14.4
SLBPQ14493 GAS5-212ENST00000434796 575 ntTSL 24.41□□□□□ -1.76e-11■■□□□ 14.4
SLBPQ14493 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.716e-11■■□□□ 14.4
SLBPQ14493 GAS5-213ENST00000436285 772 ntTSL 23.44□□□□□ -1.866e-11■■□□□ 14.4
SLBPQ14493 NUP85-201ENST00000245544 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.334e-7■■□□□ 14
SLBPQ14493 NUP85-215ENST00000580879 583 ntTSL 312.59□□□□□ -0.394e-7■■□□□ 14
SLBPQ14493 NUP85-211ENST00000579324 2010 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.734e-7■■□□□ 14
SLBPQ14493 NUP85-220ENST00000583070 907 ntTSL 510.25□□□□□ -0.774e-7■■□□□ 14
SLBPQ14493 NUP85-210ENST00000579298 1890 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.844e-7■■□□□ 14
SLBPQ14493 NUP85-203ENST00000540768 1926 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.894e-7■■□□□ 14
SLBPQ14493 NUP85-206ENST00000577645 869 ntTSL 39.2□□□□□ -0.944e-7■■□□□ 14
SLBPQ14493 NUP85-216ENST00000581104 2233 ntTSL 29.03□□□□□ -0.964e-7■■□□□ 14
SLBPQ14493 NUP85-212ENST00000579557 817 ntTSL 58.99□□□□□ -0.974e-7■■□□□ 14
SLBPQ14493 SCARNA9-201ENST00000530422 353 ntBASIC8.45□□□□□ -1.064e-7■■□□□ 14
SLBPQ14493 NUP85-208ENST00000578830 922 ntTSL 58.18□□□□□ -1.14e-7■■□□□ 14
SLBPQ14493 NUP85-217ENST00000581335 566 ntTSL 38.15□□□□□ -1.14e-7■■□□□ 14
SLBPQ14493 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.584e-7■■□□□ 14
SLBPQ14493 CEP295-203ENST00000530425 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 44.24□□□□□ -1.734e-7■■□□□ 14
SLBPQ14493 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.754e-7■■□□□ 14
SLBPQ14493 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC3.01□□□□□ -1.934e-7■■□□□ 14
SLBPQ14493 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71e-6■■□□□ 13.8
SLBPQ14493 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC8.83□□□□□ -15e-76■■□□□ 13.3
SLBPQ14493 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.611e-12■■□□□ 13.2
SLBPQ14493 NOP58-208ENST00000488403 871 ntTSL 213.97□□□□□ -0.176e-7■■□□□ 13.2
SLBPQ14493 NOP58-202ENST00000426814 655 ntTSL 213.52□□□□□ -0.256e-7■■□□□ 13.2
SLBPQ14493 NOP58-204ENST00000467734 638 ntTSL 510.75□□□□□ -0.696e-7■■□□□ 13.2
Retrieved 100 of 431 protein–RNA pairs in 76.6 ms