Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SCARF1Q14162 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SCARF1Q14162 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SCARF1Q14162 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SCARF1Q14162 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SCARF1Q14162 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SCARF1Q14162 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SCARF1Q14162 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SCARF1Q14162 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SCARF1Q14162 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SCARF1Q14162 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SCARF1Q14162 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
SCARF1Q14162 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SCARF1Q14162 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SCARF1Q14162 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
SCARF1Q14162 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SCARF1Q14162 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SCARF1Q14162 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SCARF1Q14162 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SCARF1Q14162 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SCARF1Q14162 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SCARF1Q14162 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SCARF1Q14162 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SCARF1Q14162 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SCARF1Q14162 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SCARF1Q14162 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SCARF1Q14162 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SCARF1Q14162 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
SCARF1Q14162 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SCARF1Q14162 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SCARF1Q14162 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SCARF1Q14162 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SCARF1Q14162 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SCARF1Q14162 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SCARF1Q14162 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
SCARF1Q14162 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SCARF1Q14162 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SCARF1Q14162 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
SCARF1Q14162 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SCARF1Q14162 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SCARF1Q14162 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SCARF1Q14162 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SCARF1Q14162 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SCARF1Q14162 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
SCARF1Q14162 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
SCARF1Q14162 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SCARF1Q14162 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SCARF1Q14162 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SCARF1Q14162 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SCARF1Q14162 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SCARF1Q14162 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SCARF1Q14162 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SCARF1Q14162 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
SCARF1Q14162 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SCARF1Q14162 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SCARF1Q14162 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SCARF1Q14162 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SCARF1Q14162 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SCARF1Q14162 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SCARF1Q14162 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SCARF1Q14162 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SCARF1Q14162 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SCARF1Q14162 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SCARF1Q14162 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
SCARF1Q14162 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SCARF1Q14162 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SCARF1Q14162 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SCARF1Q14162 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3.01
SCARF1Q14162 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SCARF1Q14162 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
SCARF1Q14162 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SCARF1Q14162 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SCARF1Q14162 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
SCARF1Q14162 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
SCARF1Q14162 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SCARF1Q14162 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SCARF1Q14162 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SCARF1Q14162 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SCARF1Q14162 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SCARF1Q14162 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SCARF1Q14162 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
SCARF1Q14162 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
SCARF1Q14162 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SCARF1Q14162 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SCARF1Q14162 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SCARF1Q14162 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SCARF1Q14162 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SCARF1Q14162 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SCARF1Q14162 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SCARF1Q14162 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SCARF1Q14162 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
SCARF1Q14162 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SCARF1Q14162 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SCARF1Q14162 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SCARF1Q14162 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SCARF1Q14162 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
SCARF1Q14162 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SCARF1Q14162 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SCARF1Q14162 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SCARF1Q14162 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
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