Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP1A4Q13733 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP1A4Q13733 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP1A4Q13733 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP1A4Q13733 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP1A4Q13733 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP1A4Q13733 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP1A4Q13733 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP1A4Q13733 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP1A4Q13733 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP1A4Q13733 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP1A4Q13733 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP1A4Q13733 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP1A4Q13733 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP1A4Q13733 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP1A4Q13733 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP1A4Q13733 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP1A4Q13733 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP1A4Q13733 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP1A4Q13733 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP1A4Q13733 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP1A4Q13733 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP1A4Q13733 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP1A4Q13733 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP1A4Q13733 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP1A4Q13733 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP1A4Q13733 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP1A4Q13733 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP1A4Q13733 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP1A4Q13733 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP1A4Q13733 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP1A4Q13733 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP1A4Q13733 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP1A4Q13733 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP1A4Q13733 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP1A4Q13733 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP1A4Q13733 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP1A4Q13733 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP1A4Q13733 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP1A4Q13733 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP1A4Q13733 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP1A4Q13733 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP1A4Q13733 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP1A4Q13733 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP1A4Q13733 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP1A4Q13733 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP1A4Q13733 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP1A4Q13733 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP1A4Q13733 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP1A4Q13733 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP1A4Q13733 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP1A4Q13733 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATP1A4Q13733 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP1A4Q13733 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP1A4Q13733 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP1A4Q13733 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP1A4Q13733 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP1A4Q13733 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP1A4Q13733 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP1A4Q13733 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP1A4Q13733 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP1A4Q13733 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP1A4Q13733 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP1A4Q13733 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP1A4Q13733 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP1A4Q13733 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP1A4Q13733 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP1A4Q13733 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP1A4Q13733 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ATP1A4Q13733 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP1A4Q13733 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP1A4Q13733 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP1A4Q13733 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP1A4Q13733 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP1A4Q13733 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP1A4Q13733 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP1A4Q13733 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP1A4Q13733 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP1A4Q13733 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP1A4Q13733 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP1A4Q13733 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP1A4Q13733 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP1A4Q13733 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP1A4Q13733 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP1A4Q13733 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP1A4Q13733 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP1A4Q13733 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATP1A4Q13733 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP1A4Q13733 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP1A4Q13733 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP1A4Q13733 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP1A4Q13733 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP1A4Q13733 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP1A4Q13733 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP1A4Q13733 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP1A4Q13733 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP1A4Q13733 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP1A4Q13733 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATP1A4Q13733 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP1A4Q13733 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
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