Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC40.93■■■■■ 4.14
NEUROD1Q13562 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
NEUROD1Q13562 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
NEUROD1Q13562 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
NEUROD1Q13562 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC40.87■■■■■ 4.13
NEUROD1Q13562 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
NEUROD1Q13562 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
NEUROD1Q13562 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
NEUROD1Q13562 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC40.84■■■■■ 4.13
NEUROD1Q13562 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
NEUROD1Q13562 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
NEUROD1Q13562 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
NEUROD1Q13562 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC40.82■■■■■ 4.13
NEUROD1Q13562 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC40.82■■■■■ 4.12
NEUROD1Q13562 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
NEUROD1Q13562 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
NEUROD1Q13562 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.77■■■■■ 4.12
NEUROD1Q13562 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
NEUROD1Q13562 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.73■■■■■ 4.11
NEUROD1Q13562 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.72■■■■■ 4.11
NEUROD1Q13562 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.72■■■■■ 4.11
NEUROD1Q13562 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
NEUROD1Q13562 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
NEUROD1Q13562 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
NEUROD1Q13562 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.63■■■■■ 4.1
NEUROD1Q13562 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
NEUROD1Q13562 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
NEUROD1Q13562 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC40.57■■■■■ 4.08
NEUROD1Q13562 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
NEUROD1Q13562 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC40.56■■■■■ 4.08
NEUROD1Q13562 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
NEUROD1Q13562 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
NEUROD1Q13562 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
NEUROD1Q13562 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
NEUROD1Q13562 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
NEUROD1Q13562 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.07
NEUROD1Q13562 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
NEUROD1Q13562 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
NEUROD1Q13562 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
NEUROD1Q13562 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
NEUROD1Q13562 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
NEUROD1Q13562 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC40.44■■■■■ 4.06
NEUROD1Q13562 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
NEUROD1Q13562 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
NEUROD1Q13562 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
NEUROD1Q13562 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
NEUROD1Q13562 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
NEUROD1Q13562 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
NEUROD1Q13562 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
NEUROD1Q13562 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC40.35■■■■■ 4.05
NEUROD1Q13562 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC40.35■■■■■ 4.05
NEUROD1Q13562 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC40.34■■■■■ 4.05
NEUROD1Q13562 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
NEUROD1Q13562 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
NEUROD1Q13562 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
NEUROD1Q13562 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
NEUROD1Q13562 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC40.31■■■■■ 4.04
NEUROD1Q13562 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC40.3■■■■■ 4.04
NEUROD1Q13562 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
NEUROD1Q13562 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC40.29■■■■■ 4.04
NEUROD1Q13562 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
NEUROD1Q13562 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC40.28■■■■■ 4.04
NEUROD1Q13562 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
NEUROD1Q13562 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
NEUROD1Q13562 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
NEUROD1Q13562 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
NEUROD1Q13562 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
NEUROD1Q13562 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
NEUROD1Q13562 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC40.18■■■■■ 4.02
NEUROD1Q13562 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
NEUROD1Q13562 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
NEUROD1Q13562 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC40.13■■■■■ 4.01
NEUROD1Q13562 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
NEUROD1Q13562 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC40.12■■■■■ 4.01
NEUROD1Q13562 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
NEUROD1Q13562 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
NEUROD1Q13562 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
NEUROD1Q13562 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
NEUROD1Q13562 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC40.06■■■■■ 4
NEUROD1Q13562 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
NEUROD1Q13562 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
NEUROD1Q13562 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC40.03■■■■■ 4
NEUROD1Q13562 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
NEUROD1Q13562 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
NEUROD1Q13562 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
NEUROD1Q13562 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
NEUROD1Q13562 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
NEUROD1Q13562 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC40■■■■□ 3.99
NEUROD1Q13562 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
NEUROD1Q13562 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
NEUROD1Q13562 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC39.96■■■■□ 3.99
NEUROD1Q13562 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
NEUROD1Q13562 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
NEUROD1Q13562 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
NEUROD1Q13562 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
NEUROD1Q13562 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC39.91■■■■□ 3.98
NEUROD1Q13562 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
NEUROD1Q13562 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC39.9■■■■□ 3.98
NEUROD1Q13562 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
NEUROD1Q13562 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms