Protein–RNA interactions for Protein: Q13496

MTM1, Myotubularin, humanhuman

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Length 603 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTM1Q13496 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MTM1Q13496 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MTM1Q13496 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
MTM1Q13496 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MTM1Q13496 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MTM1Q13496 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MTM1Q13496 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MTM1Q13496 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MTM1Q13496 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MTM1Q13496 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MTM1Q13496 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MTM1Q13496 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MTM1Q13496 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MTM1Q13496 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MTM1Q13496 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MTM1Q13496 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MTM1Q13496 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MTM1Q13496 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MTM1Q13496 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MTM1Q13496 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MTM1Q13496 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MTM1Q13496 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MTM1Q13496 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MTM1Q13496 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MTM1Q13496 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MTM1Q13496 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
MTM1Q13496 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MTM1Q13496 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MTM1Q13496 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MTM1Q13496 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MTM1Q13496 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MTM1Q13496 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTM1Q13496 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MTM1Q13496 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MTM1Q13496 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MTM1Q13496 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MTM1Q13496 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MTM1Q13496 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MTM1Q13496 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MTM1Q13496 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MTM1Q13496 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MTM1Q13496 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MTM1Q13496 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MTM1Q13496 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MTM1Q13496 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MTM1Q13496 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MTM1Q13496 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MTM1Q13496 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MTM1Q13496 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MTM1Q13496 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MTM1Q13496 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MTM1Q13496 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MTM1Q13496 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTM1Q13496 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTM1Q13496 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MTM1Q13496 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MTM1Q13496 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MTM1Q13496 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MTM1Q13496 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MTM1Q13496 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MTM1Q13496 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MTM1Q13496 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MTM1Q13496 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MTM1Q13496 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MTM1Q13496 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MTM1Q13496 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MTM1Q13496 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MTM1Q13496 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MTM1Q13496 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MTM1Q13496 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MTM1Q13496 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MTM1Q13496 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MTM1Q13496 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MTM1Q13496 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
MTM1Q13496 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
MTM1Q13496 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MTM1Q13496 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MTM1Q13496 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MTM1Q13496 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MTM1Q13496 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MTM1Q13496 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MTM1Q13496 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MTM1Q13496 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
MTM1Q13496 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MTM1Q13496 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MTM1Q13496 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MTM1Q13496 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MTM1Q13496 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MTM1Q13496 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
MTM1Q13496 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MTM1Q13496 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MTM1Q13496 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MTM1Q13496 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
MTM1Q13496 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MTM1Q13496 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MTM1Q13496 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MTM1Q13496 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MTM1Q13496 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MTM1Q13496 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MTM1Q13496 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
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