Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PRKAA1Q13131 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRKAA1Q13131 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRKAA1Q13131 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRKAA1Q13131 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRKAA1Q13131 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRKAA1Q13131 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRKAA1Q13131 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRKAA1Q13131 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRKAA1Q13131 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRKAA1Q13131 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRKAA1Q13131 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRKAA1Q13131 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRKAA1Q13131 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRKAA1Q13131 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRKAA1Q13131 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRKAA1Q13131 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRKAA1Q13131 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PRKAA1Q13131 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PRKAA1Q13131 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRKAA1Q13131 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PRKAA1Q13131 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PRKAA1Q13131 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRKAA1Q13131 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRKAA1Q13131 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRKAA1Q13131 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRKAA1Q13131 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRKAA1Q13131 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRKAA1Q13131 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRKAA1Q13131 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRKAA1Q13131 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRKAA1Q13131 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRKAA1Q13131 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRKAA1Q13131 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRKAA1Q13131 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRKAA1Q13131 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRKAA1Q13131 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRKAA1Q13131 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRKAA1Q13131 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRKAA1Q13131 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRKAA1Q13131 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRKAA1Q13131 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRKAA1Q13131 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRKAA1Q13131 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRKAA1Q13131 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRKAA1Q13131 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRKAA1Q13131 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRKAA1Q13131 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRKAA1Q13131 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRKAA1Q13131 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRKAA1Q13131 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRKAA1Q13131 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKAA1Q13131 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRKAA1Q13131 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRKAA1Q13131 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRKAA1Q13131 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRKAA1Q13131 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRKAA1Q13131 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRKAA1Q13131 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRKAA1Q13131 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRKAA1Q13131 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRKAA1Q13131 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRKAA1Q13131 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRKAA1Q13131 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRKAA1Q13131 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRKAA1Q13131 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRKAA1Q13131 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRKAA1Q13131 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRKAA1Q13131 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRKAA1Q13131 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRKAA1Q13131 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRKAA1Q13131 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PRKAA1Q13131 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRKAA1Q13131 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRKAA1Q13131 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRKAA1Q13131 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRKAA1Q13131 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRKAA1Q13131 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRKAA1Q13131 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRKAA1Q13131 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKAA1Q13131 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKAA1Q13131 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRKAA1Q13131 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRKAA1Q13131 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRKAA1Q13131 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRKAA1Q13131 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKAA1Q13131 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKAA1Q13131 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRKAA1Q13131 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRKAA1Q13131 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
PRKAA1Q13131 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKAA1Q13131 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKAA1Q13131 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRKAA1Q13131 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRKAA1Q13131 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PRKAA1Q13131 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRKAA1Q13131 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRKAA1Q13131 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRKAA1Q13131 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRKAA1Q13131 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
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