Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC49.25■■■■■ 5.47
PRDM2Q13029 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.24■■■■■ 5.47
PRDM2Q13029 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC49.22■■■■■ 5.47
PRDM2Q13029 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC49.21■■■■■ 5.47
PRDM2Q13029 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.21■■■■■ 5.47
PRDM2Q13029 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC49.2■■■■■ 5.47
PRDM2Q13029 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.18■■■■■ 5.46
PRDM2Q13029 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC49.16■■■■■ 5.46
PRDM2Q13029 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.1■■■■■ 5.45
PRDM2Q13029 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC49.09■■■■■ 5.45
PRDM2Q13029 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC49.07■■■■■ 5.45
PRDM2Q13029 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC49.04■■■■■ 5.44
PRDM2Q13029 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC49.03■■■■■ 5.44
PRDM2Q13029 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC49.03■■■■■ 5.44
PRDM2Q13029 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC49.03■■■■■ 5.44
PRDM2Q13029 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.02■■■■■ 5.44
PRDM2Q13029 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC49■■■■■ 5.43
PRDM2Q13029 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.99■■■■■ 5.43
PRDM2Q13029 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC48.95■■■■■ 5.43
PRDM2Q13029 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.94■■■■■ 5.43
PRDM2Q13029 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC48.94■■■■■ 5.43
PRDM2Q13029 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC48.91■■■■■ 5.42
PRDM2Q13029 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC48.91■■■■■ 5.42
PRDM2Q13029 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.89■■■■■ 5.42
PRDM2Q13029 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC48.89■■■■■ 5.42
PRDM2Q13029 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC48.88■■■■■ 5.42
PRDM2Q13029 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC48.88■■■■■ 5.41
PRDM2Q13029 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.86■■■■■ 5.41
PRDM2Q13029 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC48.86■■■■■ 5.41
PRDM2Q13029 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC48.86■■■■■ 5.41
PRDM2Q13029 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC48.85■■■■■ 5.41
PRDM2Q13029 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC48.84■■■■■ 5.41
PRDM2Q13029 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC48.83■■■■■ 5.41
PRDM2Q13029 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.82■■■■■ 5.41
PRDM2Q13029 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.8■■■■■ 5.4
PRDM2Q13029 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC48.78■■■■■ 5.4
PRDM2Q13029 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.73■■■■■ 5.39
PRDM2Q13029 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.72■■■■■ 5.39
PRDM2Q13029 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC48.72■■■■■ 5.39
PRDM2Q13029 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC48.68■■■■■ 5.38
PRDM2Q13029 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC48.67■■■■■ 5.38
PRDM2Q13029 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC48.66■■■■■ 5.38
PRDM2Q13029 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC48.64■■■■■ 5.38
PRDM2Q13029 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC48.61■■■■■ 5.37
PRDM2Q13029 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.59■■■■■ 5.37
PRDM2Q13029 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC48.59■■■■■ 5.37
PRDM2Q13029 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC48.57■■■■■ 5.37
PRDM2Q13029 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC48.55■■■■■ 5.36
PRDM2Q13029 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC48.55■■■■■ 5.36
PRDM2Q13029 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC48.54■■■■■ 5.36
PRDM2Q13029 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC48.51■■■■■ 5.36
PRDM2Q13029 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.51■■■■■ 5.36
PRDM2Q13029 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.49■■■■■ 5.35
PRDM2Q13029 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC48.46■■■■■ 5.35
PRDM2Q13029 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC48.45■■■■■ 5.35
PRDM2Q13029 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC48.43■■■■■ 5.34
PRDM2Q13029 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC48.42■■■■■ 5.34
PRDM2Q13029 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC48.42■■■■■ 5.34
PRDM2Q13029 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC48.4■■■■■ 5.34
PRDM2Q13029 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC48.4■■■■■ 5.34
PRDM2Q13029 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC48.39■■■■■ 5.34
PRDM2Q13029 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC48.36■■■■■ 5.33
PRDM2Q13029 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC48.34■■■■■ 5.33
PRDM2Q13029 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.3■■■■■ 5.32
PRDM2Q13029 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC48.3■■■■■ 5.32
PRDM2Q13029 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC48.29■■■■■ 5.32
PRDM2Q13029 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC48.29■■■■■ 5.32
PRDM2Q13029 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.28■■■■■ 5.32
PRDM2Q13029 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC48.28■■■■■ 5.32
PRDM2Q13029 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.26■■■■■ 5.32
PRDM2Q13029 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.25■■■■■ 5.31
PRDM2Q13029 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.25■■■■■ 5.31
PRDM2Q13029 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC48.24■■■■■ 5.31
PRDM2Q13029 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC48.24■■■■■ 5.31
PRDM2Q13029 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.23■■■■■ 5.31
PRDM2Q13029 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC48.21■■■■■ 5.31
PRDM2Q13029 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC48.21■■■■■ 5.31
PRDM2Q13029 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC48.21■■■■■ 5.31
PRDM2Q13029 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC48.19■■■■■ 5.31
PRDM2Q13029 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC48.1■■■■■ 5.29
PRDM2Q13029 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC48.09■■■■■ 5.29
PRDM2Q13029 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.09■■■■■ 5.29
PRDM2Q13029 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC48.09■■■■■ 5.29
PRDM2Q13029 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.08■■■■■ 5.29
PRDM2Q13029 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC48.08■■■■■ 5.29
PRDM2Q13029 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC48.06■■■■■ 5.28
PRDM2Q13029 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.05■■■■■ 5.28
PRDM2Q13029 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC48.04■■■■■ 5.28
PRDM2Q13029 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC48.04■■■■■ 5.28
PRDM2Q13029 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC48.04■■■■■ 5.28
PRDM2Q13029 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.04■■■■■ 5.28
PRDM2Q13029 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC48.02■■■■■ 5.28
PRDM2Q13029 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC48.01■■■■■ 5.28
PRDM2Q13029 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.01■■■■■ 5.28
PRDM2Q13029 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.95■■■■■ 5.27
PRDM2Q13029 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC47.95■■■■■ 5.27
PRDM2Q13029 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC47.95■■■■■ 5.27
PRDM2Q13029 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC47.94■■■■■ 5.27
PRDM2Q13029 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC47.94■■■■■ 5.27
PRDM2Q13029 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.94■■■■■ 5.26
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