Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.01■■■■■ 4.96
GOLGA3Q08378 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
GOLGA3Q08378 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
GOLGA3Q08378 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
GOLGA3Q08378 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC45.98■■■■■ 4.95
GOLGA3Q08378 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.97■■■■■ 4.95
GOLGA3Q08378 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC45.9■■■■■ 4.94
GOLGA3Q08378 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC45.88■■■■■ 4.93
GOLGA3Q08378 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.88■■■■■ 4.93
GOLGA3Q08378 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC45.87■■■■■ 4.93
GOLGA3Q08378 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.86■■■■■ 4.93
GOLGA3Q08378 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
GOLGA3Q08378 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.78■■■■■ 4.92
GOLGA3Q08378 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.77■■■■■ 4.92
GOLGA3Q08378 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC45.75■■■■■ 4.91
GOLGA3Q08378 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
GOLGA3Q08378 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
GOLGA3Q08378 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
GOLGA3Q08378 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC45.7■■■■■ 4.91
GOLGA3Q08378 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.9
GOLGA3Q08378 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC45.66■■■■■ 4.9
GOLGA3Q08378 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
GOLGA3Q08378 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.63■■■■■ 4.9
GOLGA3Q08378 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC45.62■■■■■ 4.89
GOLGA3Q08378 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.58■■■■■ 4.89
GOLGA3Q08378 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.58■■■■■ 4.89
GOLGA3Q08378 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.57■■■■■ 4.89
GOLGA3Q08378 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC45.57■■■■■ 4.88
GOLGA3Q08378 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
GOLGA3Q08378 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
GOLGA3Q08378 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
GOLGA3Q08378 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
GOLGA3Q08378 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC45.5■■■■■ 4.87
GOLGA3Q08378 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC45.5■■■■■ 4.87
GOLGA3Q08378 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC45.49■■■■■ 4.87
GOLGA3Q08378 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC45.49■■■■■ 4.87
GOLGA3Q08378 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC45.48■■■■■ 4.87
GOLGA3Q08378 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC45.47■■■■■ 4.87
GOLGA3Q08378 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC45.46■■■■■ 4.87
GOLGA3Q08378 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.44■■■■■ 4.86
GOLGA3Q08378 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.43■■■■■ 4.86
GOLGA3Q08378 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC45.42■■■■■ 4.86
GOLGA3Q08378 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.42■■■■■ 4.86
GOLGA3Q08378 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.85
GOLGA3Q08378 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.85
GOLGA3Q08378 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC45.36■■■■■ 4.85
GOLGA3Q08378 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC45.35■■■■■ 4.85
GOLGA3Q08378 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
GOLGA3Q08378 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC45.34■■■■■ 4.85
GOLGA3Q08378 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.84
GOLGA3Q08378 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
GOLGA3Q08378 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC45.26■■■■■ 4.84
GOLGA3Q08378 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
GOLGA3Q08378 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
GOLGA3Q08378 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
GOLGA3Q08378 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC45.17■■■■■ 4.82
GOLGA3Q08378 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
GOLGA3Q08378 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC45.13■■■■■ 4.82
GOLGA3Q08378 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
GOLGA3Q08378 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
GOLGA3Q08378 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC45.1■■■■■ 4.81
GOLGA3Q08378 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
GOLGA3Q08378 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
GOLGA3Q08378 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.1■■■■■ 4.81
GOLGA3Q08378 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC45.06■■■■■ 4.8
GOLGA3Q08378 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
GOLGA3Q08378 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.05■■■■■ 4.8
GOLGA3Q08378 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.04■■■■■ 4.8
GOLGA3Q08378 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC45.04■■■■■ 4.8
GOLGA3Q08378 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
GOLGA3Q08378 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC45.01■■■■■ 4.8
GOLGA3Q08378 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45■■■■■ 4.79
GOLGA3Q08378 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC44.98■■■■■ 4.79
GOLGA3Q08378 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
GOLGA3Q08378 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC44.98■■■■■ 4.79
GOLGA3Q08378 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC44.98■■■■■ 4.79
GOLGA3Q08378 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
GOLGA3Q08378 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
GOLGA3Q08378 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.96■■■■■ 4.79
GOLGA3Q08378 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
GOLGA3Q08378 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.78
GOLGA3Q08378 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
GOLGA3Q08378 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC44.92■■■■■ 4.78
GOLGA3Q08378 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
GOLGA3Q08378 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
GOLGA3Q08378 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC44.9■■■■■ 4.78
GOLGA3Q08378 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
GOLGA3Q08378 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.77
GOLGA3Q08378 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC44.87■■■■■ 4.77
GOLGA3Q08378 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
GOLGA3Q08378 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
GOLGA3Q08378 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
GOLGA3Q08378 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC44.83■■■■■ 4.77
GOLGA3Q08378 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC44.83■■■■■ 4.77
GOLGA3Q08378 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC44.83■■■■■ 4.77
GOLGA3Q08378 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
GOLGA3Q08378 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
GOLGA3Q08378 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
GOLGA3Q08378 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.79■■■■■ 4.76
GOLGA3Q08378 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms