Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKCDQ05655 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKCDQ05655 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKCDQ05655 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKCDQ05655 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKCDQ05655 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRKCDQ05655 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKCDQ05655 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKCDQ05655 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCDQ05655 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCDQ05655 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCDQ05655 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKCDQ05655 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKCDQ05655 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKCDQ05655 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKCDQ05655 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKCDQ05655 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKCDQ05655 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKCDQ05655 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKCDQ05655 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKCDQ05655 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKCDQ05655 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKCDQ05655 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKCDQ05655 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKCDQ05655 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKCDQ05655 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCDQ05655 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKCDQ05655 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKCDQ05655 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKCDQ05655 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKCDQ05655 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKCDQ05655 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKCDQ05655 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCDQ05655 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCDQ05655 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCDQ05655 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCDQ05655 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCDQ05655 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKCDQ05655 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKCDQ05655 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKCDQ05655 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKCDQ05655 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKCDQ05655 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKCDQ05655 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKCDQ05655 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRKCDQ05655 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKCDQ05655 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKCDQ05655 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKCDQ05655 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKCDQ05655 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKCDQ05655 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKCDQ05655 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCDQ05655 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCDQ05655 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKCDQ05655 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKCDQ05655 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKCDQ05655 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRKCDQ05655 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKCDQ05655 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKCDQ05655 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKCDQ05655 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKCDQ05655 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKCDQ05655 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKCDQ05655 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKCDQ05655 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKCDQ05655 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKCDQ05655 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKCDQ05655 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKCDQ05655 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKCDQ05655 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKCDQ05655 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKCDQ05655 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKCDQ05655 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKCDQ05655 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKCDQ05655 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCDQ05655 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCDQ05655 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKCDQ05655 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKCDQ05655 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKCDQ05655 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCDQ05655 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCDQ05655 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCDQ05655 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKCDQ05655 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKCDQ05655 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKCDQ05655 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCDQ05655 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKCDQ05655 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCDQ05655 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCDQ05655 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCDQ05655 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCDQ05655 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKCDQ05655 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKCDQ05655 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKCDQ05655 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKCDQ05655 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRKCDQ05655 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCDQ05655 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCDQ05655 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKCDQ05655 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms