Protein–RNA interactions for Protein: Q05397

PTK2, Focal adhesion kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK2Q05397 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTK2Q05397 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTK2Q05397 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PTK2Q05397 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTK2Q05397 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTK2Q05397 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTK2Q05397 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTK2Q05397 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTK2Q05397 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTK2Q05397 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PTK2Q05397 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTK2Q05397 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTK2Q05397 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PTK2Q05397 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PTK2Q05397 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PTK2Q05397 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PTK2Q05397 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTK2Q05397 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTK2Q05397 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTK2Q05397 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTK2Q05397 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTK2Q05397 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTK2Q05397 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTK2Q05397 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTK2Q05397 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTK2Q05397 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTK2Q05397 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTK2Q05397 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTK2Q05397 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PTK2Q05397 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTK2Q05397 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTK2Q05397 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTK2Q05397 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTK2Q05397 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTK2Q05397 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTK2Q05397 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTK2Q05397 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTK2Q05397 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTK2Q05397 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTK2Q05397 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTK2Q05397 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTK2Q05397 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTK2Q05397 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTK2Q05397 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTK2Q05397 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTK2Q05397 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTK2Q05397 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTK2Q05397 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTK2Q05397 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTK2Q05397 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTK2Q05397 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTK2Q05397 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PTK2Q05397 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTK2Q05397 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTK2Q05397 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTK2Q05397 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTK2Q05397 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTK2Q05397 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTK2Q05397 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTK2Q05397 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
PTK2Q05397 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTK2Q05397 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTK2Q05397 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTK2Q05397 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
PTK2Q05397 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTK2Q05397 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTK2Q05397 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTK2Q05397 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTK2Q05397 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTK2Q05397 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTK2Q05397 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTK2Q05397 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTK2Q05397 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTK2Q05397 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTK2Q05397 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTK2Q05397 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTK2Q05397 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTK2Q05397 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTK2Q05397 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTK2Q05397 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTK2Q05397 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTK2Q05397 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTK2Q05397 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTK2Q05397 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTK2Q05397 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTK2Q05397 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTK2Q05397 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTK2Q05397 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTK2Q05397 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTK2Q05397 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTK2Q05397 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTK2Q05397 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTK2Q05397 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTK2Q05397 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTK2Q05397 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTK2Q05397 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTK2Q05397 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTK2Q05397 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTK2Q05397 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTK2Q05397 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms