Protein–RNA interactions for Protein: Q05048

CSTF1, Cleavage stimulation factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF1Q05048 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CSTF1Q05048 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CSTF1Q05048 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CSTF1Q05048 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CSTF1Q05048 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CSTF1Q05048 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CSTF1Q05048 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CSTF1Q05048 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CSTF1Q05048 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CSTF1Q05048 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CSTF1Q05048 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CSTF1Q05048 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CSTF1Q05048 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CSTF1Q05048 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CSTF1Q05048 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CSTF1Q05048 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CSTF1Q05048 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CSTF1Q05048 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CSTF1Q05048 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CSTF1Q05048 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CSTF1Q05048 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CSTF1Q05048 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CSTF1Q05048 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CSTF1Q05048 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CSTF1Q05048 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CSTF1Q05048 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CSTF1Q05048 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CSTF1Q05048 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CSTF1Q05048 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CSTF1Q05048 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CSTF1Q05048 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CSTF1Q05048 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CSTF1Q05048 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CSTF1Q05048 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CSTF1Q05048 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CSTF1Q05048 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CSTF1Q05048 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CSTF1Q05048 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CSTF1Q05048 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CSTF1Q05048 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CSTF1Q05048 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CSTF1Q05048 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CSTF1Q05048 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CSTF1Q05048 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CSTF1Q05048 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CSTF1Q05048 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CSTF1Q05048 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CSTF1Q05048 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CSTF1Q05048 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CSTF1Q05048 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CSTF1Q05048 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CSTF1Q05048 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CSTF1Q05048 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CSTF1Q05048 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CSTF1Q05048 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CSTF1Q05048 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CSTF1Q05048 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CSTF1Q05048 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CSTF1Q05048 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CSTF1Q05048 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CSTF1Q05048 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CSTF1Q05048 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CSTF1Q05048 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CSTF1Q05048 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CSTF1Q05048 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CSTF1Q05048 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CSTF1Q05048 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CSTF1Q05048 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CSTF1Q05048 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CSTF1Q05048 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CSTF1Q05048 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CSTF1Q05048 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CSTF1Q05048 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CSTF1Q05048 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CSTF1Q05048 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSTF1Q05048 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSTF1Q05048 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSTF1Q05048 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSTF1Q05048 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSTF1Q05048 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSTF1Q05048 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSTF1Q05048 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSTF1Q05048 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSTF1Q05048 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CSTF1Q05048 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CSTF1Q05048 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CSTF1Q05048 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CSTF1Q05048 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CSTF1Q05048 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CSTF1Q05048 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CSTF1Q05048 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CSTF1Q05048 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CSTF1Q05048 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CSTF1Q05048 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CSTF1Q05048 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CSTF1Q05048 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CSTF1Q05048 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CSTF1Q05048 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CSTF1Q05048 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CSTF1Q05048 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms