Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CREMQ03060 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CREMQ03060 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
CREMQ03060 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CREMQ03060 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CREMQ03060 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
CREMQ03060 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CREMQ03060 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CREMQ03060 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CREMQ03060 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CREMQ03060 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CREMQ03060 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CREMQ03060 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CREMQ03060 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CREMQ03060 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CREMQ03060 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CREMQ03060 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CREMQ03060 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CREMQ03060 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CREMQ03060 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CREMQ03060 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CREMQ03060 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CREMQ03060 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CREMQ03060 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CREMQ03060 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CREMQ03060 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CREMQ03060 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CREMQ03060 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CREMQ03060 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CREMQ03060 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CREMQ03060 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CREMQ03060 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CREMQ03060 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CREMQ03060 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CREMQ03060 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CREMQ03060 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CREMQ03060 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CREMQ03060 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CREMQ03060 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CREMQ03060 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CREMQ03060 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CREMQ03060 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CREMQ03060 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CREMQ03060 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CREMQ03060 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CREMQ03060 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CREMQ03060 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CREMQ03060 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CREMQ03060 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CREMQ03060 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CREMQ03060 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CREMQ03060 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CREMQ03060 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CREMQ03060 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CREMQ03060 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CREMQ03060 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CREMQ03060 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CREMQ03060 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CREMQ03060 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CREMQ03060 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CREMQ03060 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CREMQ03060 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CREMQ03060 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CREMQ03060 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CREMQ03060 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CREMQ03060 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CREMQ03060 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CREMQ03060 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CREMQ03060 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CREMQ03060 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CREMQ03060 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CREMQ03060 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CREMQ03060 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CREMQ03060 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CREMQ03060 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CREMQ03060 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CREMQ03060 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CREMQ03060 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CREMQ03060 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CREMQ03060 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CREMQ03060 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CREMQ03060 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CREMQ03060 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CREMQ03060 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CREMQ03060 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CREMQ03060 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CREMQ03060 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CREMQ03060 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CREMQ03060 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CREMQ03060 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CREMQ03060 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CREMQ03060 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CREMQ03060 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CREMQ03060 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CREMQ03060 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CREMQ03060 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CREMQ03060 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CREMQ03060 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CREMQ03060 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CREMQ03060 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms