Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
CYP27A1Q02318 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CYP27A1Q02318 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CYP27A1Q02318 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CYP27A1Q02318 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CYP27A1Q02318 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CYP27A1Q02318 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CYP27A1Q02318 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CYP27A1Q02318 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CYP27A1Q02318 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CYP27A1Q02318 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CYP27A1Q02318 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CYP27A1Q02318 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CYP27A1Q02318 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CYP27A1Q02318 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CYP27A1Q02318 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CYP27A1Q02318 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CYP27A1Q02318 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CYP27A1Q02318 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CYP27A1Q02318 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CYP27A1Q02318 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CYP27A1Q02318 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CYP27A1Q02318 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CYP27A1Q02318 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CYP27A1Q02318 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CYP27A1Q02318 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CYP27A1Q02318 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CYP27A1Q02318 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CYP27A1Q02318 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CYP27A1Q02318 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CYP27A1Q02318 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CYP27A1Q02318 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CYP27A1Q02318 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CYP27A1Q02318 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CYP27A1Q02318 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CYP27A1Q02318 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CYP27A1Q02318 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CYP27A1Q02318 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CYP27A1Q02318 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CYP27A1Q02318 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CYP27A1Q02318 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CYP27A1Q02318 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CYP27A1Q02318 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CYP27A1Q02318 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CYP27A1Q02318 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CYP27A1Q02318 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CYP27A1Q02318 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CYP27A1Q02318 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CYP27A1Q02318 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CYP27A1Q02318 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CYP27A1Q02318 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CYP27A1Q02318 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CYP27A1Q02318 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CYP27A1Q02318 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CYP27A1Q02318 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CYP27A1Q02318 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CYP27A1Q02318 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CYP27A1Q02318 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CYP27A1Q02318 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CYP27A1Q02318 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
CYP27A1Q02318 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CYP27A1Q02318 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CYP27A1Q02318 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CYP27A1Q02318 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CYP27A1Q02318 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CYP27A1Q02318 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CYP27A1Q02318 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CYP27A1Q02318 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CYP27A1Q02318 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CYP27A1Q02318 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CYP27A1Q02318 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CYP27A1Q02318 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CYP27A1Q02318 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CYP27A1Q02318 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CYP27A1Q02318 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CYP27A1Q02318 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CYP27A1Q02318 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CYP27A1Q02318 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CYP27A1Q02318 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CYP27A1Q02318 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CYP27A1Q02318 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CYP27A1Q02318 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CYP27A1Q02318 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CYP27A1Q02318 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CYP27A1Q02318 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CYP27A1Q02318 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CYP27A1Q02318 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CYP27A1Q02318 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CYP27A1Q02318 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CYP27A1Q02318 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CYP27A1Q02318 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CYP27A1Q02318 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CYP27A1Q02318 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CYP27A1Q02318 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CYP27A1Q02318 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CYP27A1Q02318 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CYP27A1Q02318 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CYP27A1Q02318 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CYP27A1Q02318 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CYP27A1Q02318 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms