Protein–RNA interactions for Protein: Q01973

ROR1, Inactive tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR1, humanhuman

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROR1Q01973 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ROR1Q01973 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ROR1Q01973 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ROR1Q01973 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ROR1Q01973 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ROR1Q01973 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ROR1Q01973 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ROR1Q01973 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ROR1Q01973 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ROR1Q01973 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ROR1Q01973 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ROR1Q01973 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ROR1Q01973 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ROR1Q01973 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ROR1Q01973 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ROR1Q01973 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ROR1Q01973 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ROR1Q01973 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ROR1Q01973 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ROR1Q01973 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ROR1Q01973 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ROR1Q01973 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ROR1Q01973 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ROR1Q01973 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ROR1Q01973 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ROR1Q01973 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ROR1Q01973 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ROR1Q01973 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ROR1Q01973 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
ROR1Q01973 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
ROR1Q01973 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ROR1Q01973 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ROR1Q01973 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ROR1Q01973 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ROR1Q01973 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ROR1Q01973 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ROR1Q01973 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ROR1Q01973 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ROR1Q01973 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ROR1Q01973 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
ROR1Q01973 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ROR1Q01973 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ROR1Q01973 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ROR1Q01973 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ROR1Q01973 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ROR1Q01973 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ROR1Q01973 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ROR1Q01973 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ROR1Q01973 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
ROR1Q01973 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ROR1Q01973 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ROR1Q01973 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ROR1Q01973 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ROR1Q01973 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ROR1Q01973 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ROR1Q01973 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ROR1Q01973 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ROR1Q01973 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ROR1Q01973 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ROR1Q01973 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ROR1Q01973 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ROR1Q01973 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ROR1Q01973 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ROR1Q01973 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ROR1Q01973 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
ROR1Q01973 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ROR1Q01973 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ROR1Q01973 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ROR1Q01973 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
ROR1Q01973 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ROR1Q01973 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ROR1Q01973 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ROR1Q01973 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ROR1Q01973 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ROR1Q01973 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ROR1Q01973 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ROR1Q01973 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ROR1Q01973 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ROR1Q01973 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ROR1Q01973 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ROR1Q01973 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ROR1Q01973 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ROR1Q01973 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ROR1Q01973 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ROR1Q01973 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ROR1Q01973 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ROR1Q01973 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ROR1Q01973 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ROR1Q01973 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ROR1Q01973 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ROR1Q01973 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ROR1Q01973 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ROR1Q01973 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ROR1Q01973 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ROR1Q01973 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ROR1Q01973 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ROR1Q01973 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ROR1Q01973 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ROR1Q01973 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ROR1Q01973 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms