Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DEFA6Q01524 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DEFA6Q01524 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DEFA6Q01524 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DEFA6Q01524 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DEFA6Q01524 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DEFA6Q01524 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DEFA6Q01524 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DEFA6Q01524 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DEFA6Q01524 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DEFA6Q01524 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DEFA6Q01524 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DEFA6Q01524 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DEFA6Q01524 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DEFA6Q01524 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DEFA6Q01524 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DEFA6Q01524 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DEFA6Q01524 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DEFA6Q01524 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DEFA6Q01524 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DEFA6Q01524 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DEFA6Q01524 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DEFA6Q01524 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DEFA6Q01524 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DEFA6Q01524 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DEFA6Q01524 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DEFA6Q01524 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DEFA6Q01524 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEFA6Q01524 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEFA6Q01524 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DEFA6Q01524 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DEFA6Q01524 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DEFA6Q01524 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DEFA6Q01524 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DEFA6Q01524 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DEFA6Q01524 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEFA6Q01524 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEFA6Q01524 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DEFA6Q01524 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DEFA6Q01524 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEFA6Q01524 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEFA6Q01524 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEFA6Q01524 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEFA6Q01524 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEFA6Q01524 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEFA6Q01524 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DEFA6Q01524 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEFA6Q01524 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DEFA6Q01524 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DEFA6Q01524 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEFA6Q01524 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEFA6Q01524 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEFA6Q01524 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DEFA6Q01524 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DEFA6Q01524 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DEFA6Q01524 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DEFA6Q01524 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DEFA6Q01524 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DEFA6Q01524 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DEFA6Q01524 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DEFA6Q01524 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DEFA6Q01524 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DEFA6Q01524 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DEFA6Q01524 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
DEFA6Q01524 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DEFA6Q01524 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
DEFA6Q01524 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DEFA6Q01524 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DEFA6Q01524 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DEFA6Q01524 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DEFA6Q01524 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
DEFA6Q01524 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DEFA6Q01524 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DEFA6Q01524 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DEFA6Q01524 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DEFA6Q01524 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DEFA6Q01524 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DEFA6Q01524 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DEFA6Q01524 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DEFA6Q01524 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DEFA6Q01524 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DEFA6Q01524 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DEFA6Q01524 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DEFA6Q01524 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DEFA6Q01524 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DEFA6Q01524 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DEFA6Q01524 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DEFA6Q01524 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DEFA6Q01524 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DEFA6Q01524 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DEFA6Q01524 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DEFA6Q01524 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DEFA6Q01524 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
DEFA6Q01524 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DEFA6Q01524 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DEFA6Q01524 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DEFA6Q01524 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DEFA6Q01524 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DEFA6Q01524 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DEFA6Q01524 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms