Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
SCN7AQ01118 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
SCN7AQ01118 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
SCN7AQ01118 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
SCN7AQ01118 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
SCN7AQ01118 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
SCN7AQ01118 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
SCN7AQ01118 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
SCN7AQ01118 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
SCN7AQ01118 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
SCN7AQ01118 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
SCN7AQ01118 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
SCN7AQ01118 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
SCN7AQ01118 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.29
SCN7AQ01118 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
SCN7AQ01118 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC35.52■■■■□ 3.28
SCN7AQ01118 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
SCN7AQ01118 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
SCN7AQ01118 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
SCN7AQ01118 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
SCN7AQ01118 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
SCN7AQ01118 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
SCN7AQ01118 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
SCN7AQ01118 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
SCN7AQ01118 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC35.4■■■■□ 3.26
SCN7AQ01118 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
SCN7AQ01118 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
SCN7AQ01118 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
SCN7AQ01118 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
SCN7AQ01118 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
SCN7AQ01118 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
SCN7AQ01118 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
SCN7AQ01118 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SCN7AQ01118 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
SCN7AQ01118 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
SCN7AQ01118 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SCN7AQ01118 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
SCN7AQ01118 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SCN7AQ01118 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
SCN7AQ01118 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
SCN7AQ01118 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SCN7AQ01118 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
SCN7AQ01118 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SCN7AQ01118 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
SCN7AQ01118 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
SCN7AQ01118 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
SCN7AQ01118 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
SCN7AQ01118 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SCN7AQ01118 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SCN7AQ01118 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SCN7AQ01118 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SCN7AQ01118 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
SCN7AQ01118 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
SCN7AQ01118 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SCN7AQ01118 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SCN7AQ01118 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SCN7AQ01118 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SCN7AQ01118 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
SCN7AQ01118 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SCN7AQ01118 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
SCN7AQ01118 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SCN7AQ01118 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
SCN7AQ01118 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
SCN7AQ01118 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
SCN7AQ01118 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
SCN7AQ01118 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
SCN7AQ01118 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC35.11■■■■□ 3.21
SCN7AQ01118 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
SCN7AQ01118 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
SCN7AQ01118 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
SCN7AQ01118 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
SCN7AQ01118 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
SCN7AQ01118 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SCN7AQ01118 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
SCN7AQ01118 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SCN7AQ01118 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
SCN7AQ01118 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SCN7AQ01118 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
SCN7AQ01118 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
SCN7AQ01118 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
SCN7AQ01118 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SCN7AQ01118 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
SCN7AQ01118 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
SCN7AQ01118 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
SCN7AQ01118 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
SCN7AQ01118 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
SCN7AQ01118 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
SCN7AQ01118 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
SCN7AQ01118 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
SCN7AQ01118 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
SCN7AQ01118 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
SCN7AQ01118 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
SCN7AQ01118 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
SCN7AQ01118 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
SCN7AQ01118 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
SCN7AQ01118 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
SCN7AQ01118 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SCN7AQ01118 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
SCN7AQ01118 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
SCN7AQ01118 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms