Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDKL1Q00532 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDKL1Q00532 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDKL1Q00532 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDKL1Q00532 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDKL1Q00532 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDKL1Q00532 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDKL1Q00532 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDKL1Q00532 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDKL1Q00532 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CDKL1Q00532 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDKL1Q00532 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDKL1Q00532 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDKL1Q00532 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDKL1Q00532 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDKL1Q00532 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDKL1Q00532 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDKL1Q00532 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDKL1Q00532 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDKL1Q00532 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDKL1Q00532 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDKL1Q00532 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDKL1Q00532 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDKL1Q00532 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDKL1Q00532 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CDKL1Q00532 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDKL1Q00532 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDKL1Q00532 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDKL1Q00532 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDKL1Q00532 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDKL1Q00532 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDKL1Q00532 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDKL1Q00532 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDKL1Q00532 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDKL1Q00532 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CDKL1Q00532 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDKL1Q00532 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDKL1Q00532 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDKL1Q00532 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDKL1Q00532 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDKL1Q00532 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDKL1Q00532 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDKL1Q00532 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDKL1Q00532 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDKL1Q00532 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDKL1Q00532 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDKL1Q00532 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDKL1Q00532 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDKL1Q00532 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDKL1Q00532 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDKL1Q00532 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDKL1Q00532 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDKL1Q00532 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDKL1Q00532 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDKL1Q00532 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDKL1Q00532 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDKL1Q00532 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDKL1Q00532 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDKL1Q00532 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDKL1Q00532 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDKL1Q00532 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDKL1Q00532 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDKL1Q00532 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDKL1Q00532 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDKL1Q00532 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDKL1Q00532 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDKL1Q00532 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDKL1Q00532 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDKL1Q00532 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CDKL1Q00532 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDKL1Q00532 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CDKL1Q00532 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDKL1Q00532 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDKL1Q00532 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDKL1Q00532 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDKL1Q00532 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDKL1Q00532 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDKL1Q00532 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDKL1Q00532 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDKL1Q00532 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDKL1Q00532 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDKL1Q00532 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDKL1Q00532 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDKL1Q00532 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDKL1Q00532 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDKL1Q00532 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDKL1Q00532 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDKL1Q00532 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDKL1Q00532 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDKL1Q00532 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDKL1Q00532 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDKL1Q00532 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDKL1Q00532 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDKL1Q00532 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDKL1Q00532 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDKL1Q00532 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDKL1Q00532 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDKL1Q00532 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDKL1Q00532 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDKL1Q00532 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms