Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS29P62273 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS29P62273 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS29P62273 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS29P62273 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS29P62273 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS29P62273 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS29P62273 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS29P62273 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS29P62273 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS29P62273 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS29P62273 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS29P62273 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS29P62273 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS29P62273 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS29P62273 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS29P62273 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS29P62273 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS29P62273 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS29P62273 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS29P62273 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPS29P62273 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPS29P62273 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPS29P62273 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPS29P62273 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPS29P62273 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPS29P62273 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPS29P62273 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPS29P62273 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS29P62273 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS29P62273 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS29P62273 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS29P62273 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPS29P62273 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPS29P62273 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPS29P62273 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPS29P62273 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS29P62273 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS29P62273 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS29P62273 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS29P62273 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS29P62273 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS29P62273 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS29P62273 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS29P62273 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS29P62273 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS29P62273 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS29P62273 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS29P62273 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS29P62273 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS29P62273 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS29P62273 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPS29P62273 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPS29P62273 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPS29P62273 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPS29P62273 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RPS29P62273 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPS29P62273 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPS29P62273 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RPS29P62273 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPS29P62273 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPS29P62273 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPS29P62273 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPS29P62273 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPS29P62273 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS29P62273 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS29P62273 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS29P62273 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS29P62273 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS29P62273 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS29P62273 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS29P62273 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS29P62273 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS29P62273 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS29P62273 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS29P62273 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS29P62273 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS29P62273 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS29P62273 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS29P62273 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS29P62273 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS29P62273 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS29P62273 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS29P62273 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS29P62273 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS29P62273 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPS29P62273 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPS29P62273 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPS29P62273 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPS29P62273 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPS29P62273 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPS29P62273 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS29P62273 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS29P62273 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS29P62273 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS29P62273 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS29P62273 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS29P62273 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS29P62273 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS29P62273 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms