Protein–RNA interactions for Protein: P62136

PPP1CA, Serine/threonine-protein phosphatase PP1-alpha catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CAP62136 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPP1CAP62136 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPP1CAP62136 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPP1CAP62136 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPP1CAP62136 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PPP1CAP62136 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPP1CAP62136 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPP1CAP62136 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PPP1CAP62136 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPP1CAP62136 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPP1CAP62136 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPP1CAP62136 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPP1CAP62136 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPP1CAP62136 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPP1CAP62136 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPP1CAP62136 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPP1CAP62136 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPP1CAP62136 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPP1CAP62136 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPP1CAP62136 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PPP1CAP62136 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PPP1CAP62136 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPP1CAP62136 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPP1CAP62136 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPP1CAP62136 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPP1CAP62136 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPP1CAP62136 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPP1CAP62136 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPP1CAP62136 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPP1CAP62136 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPP1CAP62136 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PPP1CAP62136 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PPP1CAP62136 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPP1CAP62136 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPP1CAP62136 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPP1CAP62136 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPP1CAP62136 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPP1CAP62136 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPP1CAP62136 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPP1CAP62136 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPP1CAP62136 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPP1CAP62136 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPP1CAP62136 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPP1CAP62136 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPP1CAP62136 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPP1CAP62136 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPP1CAP62136 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPP1CAP62136 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PPP1CAP62136 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPP1CAP62136 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPP1CAP62136 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPP1CAP62136 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPP1CAP62136 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PPP1CAP62136 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PPP1CAP62136 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PPP1CAP62136 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PPP1CAP62136 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPP1CAP62136 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPP1CAP62136 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPP1CAP62136 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPP1CAP62136 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PPP1CAP62136 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PPP1CAP62136 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPP1CAP62136 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPP1CAP62136 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPP1CAP62136 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPP1CAP62136 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPP1CAP62136 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PPP1CAP62136 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PPP1CAP62136 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PPP1CAP62136 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PPP1CAP62136 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPP1CAP62136 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPP1CAP62136 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPP1CAP62136 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPP1CAP62136 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPP1CAP62136 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPP1CAP62136 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPP1CAP62136 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPP1CAP62136 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPP1CAP62136 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PPP1CAP62136 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPP1CAP62136 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPP1CAP62136 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPP1CAP62136 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPP1CAP62136 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPP1CAP62136 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPP1CAP62136 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPP1CAP62136 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PPP1CAP62136 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPP1CAP62136 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPP1CAP62136 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPP1CAP62136 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPP1CAP62136 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPP1CAP62136 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPP1CAP62136 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPP1CAP62136 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPP1CAP62136 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPP1CAP62136 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPP1CAP62136 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms