Protein–RNA interactions for Protein: P60891

PRPS1, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPS1P60891 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPS1P60891 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPS1P60891 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPS1P60891 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPS1P60891 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPS1P60891 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPS1P60891 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPS1P60891 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPS1P60891 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPS1P60891 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPS1P60891 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPS1P60891 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPS1P60891 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPS1P60891 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPS1P60891 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPS1P60891 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPS1P60891 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPS1P60891 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPS1P60891 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPS1P60891 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPS1P60891 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPS1P60891 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPS1P60891 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPS1P60891 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPS1P60891 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPS1P60891 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPS1P60891 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPS1P60891 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPS1P60891 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPS1P60891 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPS1P60891 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPS1P60891 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PRPS1P60891 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRPS1P60891 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRPS1P60891 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPS1P60891 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPS1P60891 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPS1P60891 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPS1P60891 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPS1P60891 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPS1P60891 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPS1P60891 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPS1P60891 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRPS1P60891 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPS1P60891 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPS1P60891 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPS1P60891 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPS1P60891 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPS1P60891 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPS1P60891 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPS1P60891 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPS1P60891 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPS1P60891 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPS1P60891 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPS1P60891 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPS1P60891 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPS1P60891 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPS1P60891 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPS1P60891 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPS1P60891 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPS1P60891 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPS1P60891 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPS1P60891 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPS1P60891 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPS1P60891 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPS1P60891 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPS1P60891 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPS1P60891 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPS1P60891 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPS1P60891 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPS1P60891 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPS1P60891 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPS1P60891 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPS1P60891 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPS1P60891 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPS1P60891 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPS1P60891 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPS1P60891 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPS1P60891 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPS1P60891 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPS1P60891 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPS1P60891 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPS1P60891 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPS1P60891 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPS1P60891 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPS1P60891 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPS1P60891 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPS1P60891 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPS1P60891 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPS1P60891 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRPS1P60891 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPS1P60891 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPS1P60891 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPS1P60891 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPS1P60891 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPS1P60891 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPS1P60891 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPS1P60891 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPS1P60891 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPS1P60891 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms