Protein–RNA interactions for Protein: P59826

BPIFB3, BPI fold-containing family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFB3P59826 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BPIFB3P59826 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BPIFB3P59826 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BPIFB3P59826 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BPIFB3P59826 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BPIFB3P59826 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BPIFB3P59826 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BPIFB3P59826 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BPIFB3P59826 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BPIFB3P59826 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BPIFB3P59826 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BPIFB3P59826 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BPIFB3P59826 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BPIFB3P59826 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BPIFB3P59826 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BPIFB3P59826 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BPIFB3P59826 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BPIFB3P59826 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BPIFB3P59826 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BPIFB3P59826 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BPIFB3P59826 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BPIFB3P59826 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BPIFB3P59826 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BPIFB3P59826 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BPIFB3P59826 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BPIFB3P59826 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BPIFB3P59826 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BPIFB3P59826 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BPIFB3P59826 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BPIFB3P59826 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BPIFB3P59826 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BPIFB3P59826 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPIFB3P59826 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPIFB3P59826 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BPIFB3P59826 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BPIFB3P59826 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BPIFB3P59826 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BPIFB3P59826 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BPIFB3P59826 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BPIFB3P59826 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPIFB3P59826 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BPIFB3P59826 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPIFB3P59826 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BPIFB3P59826 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BPIFB3P59826 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BPIFB3P59826 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BPIFB3P59826 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BPIFB3P59826 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BPIFB3P59826 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BPIFB3P59826 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BPIFB3P59826 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BPIFB3P59826 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BPIFB3P59826 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BPIFB3P59826 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BPIFB3P59826 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BPIFB3P59826 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BPIFB3P59826 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BPIFB3P59826 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BPIFB3P59826 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BPIFB3P59826 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BPIFB3P59826 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BPIFB3P59826 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BPIFB3P59826 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BPIFB3P59826 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BPIFB3P59826 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BPIFB3P59826 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BPIFB3P59826 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BPIFB3P59826 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BPIFB3P59826 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BPIFB3P59826 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BPIFB3P59826 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BPIFB3P59826 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BPIFB3P59826 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BPIFB3P59826 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BPIFB3P59826 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BPIFB3P59826 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BPIFB3P59826 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BPIFB3P59826 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BPIFB3P59826 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BPIFB3P59826 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BPIFB3P59826 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BPIFB3P59826 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BPIFB3P59826 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BPIFB3P59826 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BPIFB3P59826 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BPIFB3P59826 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BPIFB3P59826 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BPIFB3P59826 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BPIFB3P59826 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BPIFB3P59826 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BPIFB3P59826 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BPIFB3P59826 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BPIFB3P59826 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BPIFB3P59826 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BPIFB3P59826 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BPIFB3P59826 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BPIFB3P59826 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BPIFB3P59826 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BPIFB3P59826 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BPIFB3P59826 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 203 ms