Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLDN2P57739 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLDN2P57739 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLDN2P57739 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLDN2P57739 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLDN2P57739 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLDN2P57739 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLDN2P57739 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLDN2P57739 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLDN2P57739 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLDN2P57739 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLDN2P57739 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLDN2P57739 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLDN2P57739 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLDN2P57739 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLDN2P57739 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLDN2P57739 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLDN2P57739 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CLDN2P57739 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CLDN2P57739 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLDN2P57739 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLDN2P57739 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLDN2P57739 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLDN2P57739 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLDN2P57739 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLDN2P57739 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLDN2P57739 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CLDN2P57739 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLDN2P57739 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLDN2P57739 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLDN2P57739 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CLDN2P57739 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CLDN2P57739 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CLDN2P57739 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLDN2P57739 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLDN2P57739 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLDN2P57739 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLDN2P57739 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLDN2P57739 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLDN2P57739 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLDN2P57739 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLDN2P57739 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLDN2P57739 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLDN2P57739 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLDN2P57739 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLDN2P57739 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLDN2P57739 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLDN2P57739 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLDN2P57739 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLDN2P57739 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLDN2P57739 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLDN2P57739 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLDN2P57739 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLDN2P57739 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLDN2P57739 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLDN2P57739 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CLDN2P57739 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLDN2P57739 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLDN2P57739 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLDN2P57739 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLDN2P57739 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLDN2P57739 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLDN2P57739 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CLDN2P57739 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLDN2P57739 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLDN2P57739 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLDN2P57739 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLDN2P57739 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLDN2P57739 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLDN2P57739 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CLDN2P57739 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLDN2P57739 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLDN2P57739 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLDN2P57739 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLDN2P57739 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLDN2P57739 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLDN2P57739 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CLDN2P57739 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLDN2P57739 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLDN2P57739 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLDN2P57739 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLDN2P57739 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLDN2P57739 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLDN2P57739 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLDN2P57739 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLDN2P57739 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLDN2P57739 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLDN2P57739 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLDN2P57739 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CLDN2P57739 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CLDN2P57739 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLDN2P57739 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLDN2P57739 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLDN2P57739 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLDN2P57739 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLDN2P57739 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CLDN2P57739 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLDN2P57739 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLDN2P57739 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLDN2P57739 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms