Protein–RNA interactions for Protein: P56715

RP1, Oxygen-regulated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP1P56715 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RP1P56715 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RP1P56715 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RP1P56715 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RP1P56715 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RP1P56715 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RP1P56715 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
RP1P56715 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RP1P56715 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RP1P56715 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RP1P56715 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RP1P56715 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RP1P56715 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RP1P56715 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RP1P56715 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RP1P56715 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RP1P56715 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RP1P56715 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RP1P56715 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RP1P56715 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RP1P56715 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RP1P56715 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RP1P56715 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
RP1P56715 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RP1P56715 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RP1P56715 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RP1P56715 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RP1P56715 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RP1P56715 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RP1P56715 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RP1P56715 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RP1P56715 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RP1P56715 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RP1P56715 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RP1P56715 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RP1P56715 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RP1P56715 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RP1P56715 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RP1P56715 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RP1P56715 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RP1P56715 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RP1P56715 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RP1P56715 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RP1P56715 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RP1P56715 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RP1P56715 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RP1P56715 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RP1P56715 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RP1P56715 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RP1P56715 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RP1P56715 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RP1P56715 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RP1P56715 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RP1P56715 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RP1P56715 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RP1P56715 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RP1P56715 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RP1P56715 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RP1P56715 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RP1P56715 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RP1P56715 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RP1P56715 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RP1P56715 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RP1P56715 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RP1P56715 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RP1P56715 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RP1P56715 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RP1P56715 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RP1P56715 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RP1P56715 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RP1P56715 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RP1P56715 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RP1P56715 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RP1P56715 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RP1P56715 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
RP1P56715 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RP1P56715 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RP1P56715 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RP1P56715 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RP1P56715 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RP1P56715 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RP1P56715 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RP1P56715 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RP1P56715 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RP1P56715 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RP1P56715 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RP1P56715 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RP1P56715 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RP1P56715 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RP1P56715 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RP1P56715 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RP1P56715 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RP1P56715 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
RP1P56715 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RP1P56715 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RP1P56715 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RP1P56715 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RP1P56715 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RP1P56715 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RP1P56715 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms