Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SUMO3P55854 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUMO3P55854 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SUMO3P55854 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SUMO3P55854 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUMO3P55854 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUMO3P55854 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUMO3P55854 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SUMO3P55854 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUMO3P55854 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUMO3P55854 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUMO3P55854 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUMO3P55854 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUMO3P55854 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUMO3P55854 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUMO3P55854 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUMO3P55854 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUMO3P55854 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUMO3P55854 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUMO3P55854 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SUMO3P55854 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SUMO3P55854 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SUMO3P55854 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SUMO3P55854 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SUMO3P55854 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SUMO3P55854 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SUMO3P55854 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SUMO3P55854 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SUMO3P55854 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUMO3P55854 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUMO3P55854 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SUMO3P55854 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SUMO3P55854 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SUMO3P55854 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SUMO3P55854 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUMO3P55854 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUMO3P55854 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SUMO3P55854 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SUMO3P55854 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SUMO3P55854 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SUMO3P55854 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUMO3P55854 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SUMO3P55854 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SUMO3P55854 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SUMO3P55854 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SUMO3P55854 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SUMO3P55854 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SUMO3P55854 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SUMO3P55854 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SUMO3P55854 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SUMO3P55854 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SUMO3P55854 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SUMO3P55854 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SUMO3P55854 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SUMO3P55854 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SUMO3P55854 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SUMO3P55854 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SUMO3P55854 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SUMO3P55854 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SUMO3P55854 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SUMO3P55854 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SUMO3P55854 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SUMO3P55854 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SUMO3P55854 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SUMO3P55854 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SUMO3P55854 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SUMO3P55854 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SUMO3P55854 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SUMO3P55854 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SUMO3P55854 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SUMO3P55854 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SUMO3P55854 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SUMO3P55854 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SUMO3P55854 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SUMO3P55854 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SUMO3P55854 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SUMO3P55854 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SUMO3P55854 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SUMO3P55854 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SUMO3P55854 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SUMO3P55854 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SUMO3P55854 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SUMO3P55854 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SUMO3P55854 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SUMO3P55854 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SUMO3P55854 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SUMO3P55854 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SUMO3P55854 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SUMO3P55854 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SUMO3P55854 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SUMO3P55854 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SUMO3P55854 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SUMO3P55854 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SUMO3P55854 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SUMO3P55854 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SUMO3P55854 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SUMO3P55854 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SUMO3P55854 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SUMO3P55854 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SUMO3P55854 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms