Protein–RNA interactions for Protein: P54764

EPHA4, Ephrin type-A receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA4P54764 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EPHA4P54764 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EPHA4P54764 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
EPHA4P54764 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EPHA4P54764 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EPHA4P54764 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EPHA4P54764 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
EPHA4P54764 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
EPHA4P54764 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EPHA4P54764 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EPHA4P54764 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
EPHA4P54764 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EPHA4P54764 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EPHA4P54764 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EPHA4P54764 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EPHA4P54764 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
EPHA4P54764 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EPHA4P54764 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EPHA4P54764 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EPHA4P54764 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EPHA4P54764 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EPHA4P54764 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EPHA4P54764 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EPHA4P54764 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EPHA4P54764 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
EPHA4P54764 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EPHA4P54764 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EPHA4P54764 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
EPHA4P54764 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EPHA4P54764 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EPHA4P54764 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EPHA4P54764 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EPHA4P54764 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EPHA4P54764 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EPHA4P54764 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EPHA4P54764 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EPHA4P54764 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EPHA4P54764 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EPHA4P54764 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EPHA4P54764 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EPHA4P54764 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EPHA4P54764 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EPHA4P54764 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EPHA4P54764 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EPHA4P54764 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EPHA4P54764 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EPHA4P54764 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EPHA4P54764 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EPHA4P54764 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EPHA4P54764 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EPHA4P54764 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EPHA4P54764 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EPHA4P54764 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EPHA4P54764 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EPHA4P54764 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
EPHA4P54764 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EPHA4P54764 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EPHA4P54764 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
EPHA4P54764 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EPHA4P54764 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
EPHA4P54764 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EPHA4P54764 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
EPHA4P54764 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EPHA4P54764 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EPHA4P54764 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EPHA4P54764 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EPHA4P54764 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EPHA4P54764 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
EPHA4P54764 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EPHA4P54764 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EPHA4P54764 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
EPHA4P54764 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EPHA4P54764 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EPHA4P54764 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
EPHA4P54764 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EPHA4P54764 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EPHA4P54764 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EPHA4P54764 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EPHA4P54764 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EPHA4P54764 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EPHA4P54764 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EPHA4P54764 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EPHA4P54764 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EPHA4P54764 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
EPHA4P54764 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EPHA4P54764 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EPHA4P54764 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EPHA4P54764 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EPHA4P54764 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EPHA4P54764 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EPHA4P54764 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EPHA4P54764 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EPHA4P54764 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EPHA4P54764 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
EPHA4P54764 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EPHA4P54764 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EPHA4P54764 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
EPHA4P54764 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EPHA4P54764 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EPHA4P54764 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms