Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
AP3M2P53677 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
AP3M2P53677 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
AP3M2P53677 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
AP3M2P53677 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
AP3M2P53677 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
AP3M2P53677 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
AP3M2P53677 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
AP3M2P53677 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
AP3M2P53677 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
AP3M2P53677 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
AP3M2P53677 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
AP3M2P53677 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
AP3M2P53677 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
AP3M2P53677 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
AP3M2P53677 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
AP3M2P53677 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
AP3M2P53677 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
AP3M2P53677 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
AP3M2P53677 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
AP3M2P53677 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
AP3M2P53677 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
AP3M2P53677 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
AP3M2P53677 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
AP3M2P53677 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
AP3M2P53677 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
AP3M2P53677 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
AP3M2P53677 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
AP3M2P53677 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
AP3M2P53677 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
AP3M2P53677 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
AP3M2P53677 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
AP3M2P53677 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
AP3M2P53677 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
AP3M2P53677 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
AP3M2P53677 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
AP3M2P53677 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
AP3M2P53677 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
AP3M2P53677 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
AP3M2P53677 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
AP3M2P53677 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
AP3M2P53677 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
AP3M2P53677 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
AP3M2P53677 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
AP3M2P53677 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
AP3M2P53677 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
AP3M2P53677 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
AP3M2P53677 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
AP3M2P53677 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
AP3M2P53677 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
AP3M2P53677 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
AP3M2P53677 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
AP3M2P53677 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
AP3M2P53677 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
AP3M2P53677 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
AP3M2P53677 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
AP3M2P53677 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
AP3M2P53677 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
AP3M2P53677 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
AP3M2P53677 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
AP3M2P53677 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
AP3M2P53677 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
AP3M2P53677 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
AP3M2P53677 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
AP3M2P53677 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
AP3M2P53677 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
AP3M2P53677 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
AP3M2P53677 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
AP3M2P53677 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
AP3M2P53677 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
AP3M2P53677 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
AP3M2P53677 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
AP3M2P53677 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
AP3M2P53677 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
AP3M2P53677 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
AP3M2P53677 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
AP3M2P53677 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
AP3M2P53677 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
AP3M2P53677 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
AP3M2P53677 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
AP3M2P53677 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
AP3M2P53677 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
AP3M2P53677 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
AP3M2P53677 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
AP3M2P53677 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
AP3M2P53677 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
AP3M2P53677 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
AP3M2P53677 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
AP3M2P53677 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
AP3M2P53677 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
AP3M2P53677 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
AP3M2P53677 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
AP3M2P53677 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
AP3M2P53677 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.29
AP3M2P53677 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
AP3M2P53677 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
AP3M2P53677 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
AP3M2P53677 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
AP3M2P53677 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
AP3M2P53677 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms