Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.95■■■■□ 3.51
AP3M2P53677 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
AP3M2P53677 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36■■■■□ 3.35
AP3M2P53677 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
AP3M2P53677 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
AP3M2P53677 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
AP3M2P53677 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
AP3M2P53677 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
AP3M2P53677 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
AP3M2P53677 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
AP3M2P53677 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
AP3M2P53677 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
AP3M2P53677 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
AP3M2P53677 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
AP3M2P53677 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
AP3M2P53677 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
AP3M2P53677 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
AP3M2P53677 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
AP3M2P53677 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
AP3M2P53677 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
AP3M2P53677 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
AP3M2P53677 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
AP3M2P53677 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
AP3M2P53677 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
AP3M2P53677 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
AP3M2P53677 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
AP3M2P53677 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
AP3M2P53677 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
AP3M2P53677 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
AP3M2P53677 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
AP3M2P53677 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
AP3M2P53677 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
AP3M2P53677 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
AP3M2P53677 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
AP3M2P53677 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
AP3M2P53677 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
AP3M2P53677 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
AP3M2P53677 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
AP3M2P53677 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
AP3M2P53677 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
AP3M2P53677 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
AP3M2P53677 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
AP3M2P53677 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
AP3M2P53677 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
AP3M2P53677 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
AP3M2P53677 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
AP3M2P53677 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
AP3M2P53677 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
AP3M2P53677 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
AP3M2P53677 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
AP3M2P53677 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
AP3M2P53677 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
AP3M2P53677 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
AP3M2P53677 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
AP3M2P53677 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
AP3M2P53677 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
AP3M2P53677 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
AP3M2P53677 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
AP3M2P53677 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
AP3M2P53677 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
AP3M2P53677 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
AP3M2P53677 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
AP3M2P53677 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
AP3M2P53677 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
AP3M2P53677 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
AP3M2P53677 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
AP3M2P53677 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
AP3M2P53677 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.89■■■□□ 2.7
AP3M2P53677 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
AP3M2P53677 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
AP3M2P53677 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.86■■■□□ 2.69
AP3M2P53677 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
AP3M2P53677 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
AP3M2P53677 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
AP3M2P53677 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
AP3M2P53677 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
AP3M2P53677 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
AP3M2P53677 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
AP3M2P53677 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
AP3M2P53677 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
AP3M2P53677 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
AP3M2P53677 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
AP3M2P53677 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
AP3M2P53677 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
AP3M2P53677 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
AP3M2P53677 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
AP3M2P53677 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
AP3M2P53677 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
AP3M2P53677 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
AP3M2P53677 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
AP3M2P53677 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
AP3M2P53677 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
AP3M2P53677 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
AP3M2P53677 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
AP3M2P53677 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
AP3M2P53677 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
AP3M2P53677 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
AP3M2P53677 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
AP3M2P53677 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
AP3M2P53677 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms