Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LIMK2P53671 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LIMK2P53671 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LIMK2P53671 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
LIMK2P53671 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LIMK2P53671 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LIMK2P53671 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LIMK2P53671 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LIMK2P53671 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LIMK2P53671 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LIMK2P53671 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LIMK2P53671 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LIMK2P53671 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LIMK2P53671 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LIMK2P53671 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
LIMK2P53671 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LIMK2P53671 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LIMK2P53671 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LIMK2P53671 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LIMK2P53671 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LIMK2P53671 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LIMK2P53671 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LIMK2P53671 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LIMK2P53671 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LIMK2P53671 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LIMK2P53671 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LIMK2P53671 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LIMK2P53671 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LIMK2P53671 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LIMK2P53671 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LIMK2P53671 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LIMK2P53671 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LIMK2P53671 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LIMK2P53671 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LIMK2P53671 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LIMK2P53671 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LIMK2P53671 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LIMK2P53671 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LIMK2P53671 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LIMK2P53671 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LIMK2P53671 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LIMK2P53671 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LIMK2P53671 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LIMK2P53671 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LIMK2P53671 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LIMK2P53671 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LIMK2P53671 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LIMK2P53671 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LIMK2P53671 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LIMK2P53671 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LIMK2P53671 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LIMK2P53671 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LIMK2P53671 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LIMK2P53671 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LIMK2P53671 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LIMK2P53671 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LIMK2P53671 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LIMK2P53671 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LIMK2P53671 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LIMK2P53671 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LIMK2P53671 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LIMK2P53671 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LIMK2P53671 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LIMK2P53671 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LIMK2P53671 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LIMK2P53671 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LIMK2P53671 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LIMK2P53671 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LIMK2P53671 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LIMK2P53671 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LIMK2P53671 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LIMK2P53671 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
LIMK2P53671 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LIMK2P53671 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LIMK2P53671 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LIMK2P53671 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LIMK2P53671 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LIMK2P53671 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LIMK2P53671 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
LIMK2P53671 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LIMK2P53671 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LIMK2P53671 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LIMK2P53671 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LIMK2P53671 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LIMK2P53671 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LIMK2P53671 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LIMK2P53671 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LIMK2P53671 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LIMK2P53671 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LIMK2P53671 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LIMK2P53671 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LIMK2P53671 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LIMK2P53671 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LIMK2P53671 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LIMK2P53671 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LIMK2P53671 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LIMK2P53671 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LIMK2P53671 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LIMK2P53671 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LIMK2P53671 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms