Protein–RNA interactions for Protein: P53384

NUBP1, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP1, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP1P53384 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NUBP1P53384 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NUBP1P53384 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUBP1P53384 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUBP1P53384 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NUBP1P53384 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
NUBP1P53384 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NUBP1P53384 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
NUBP1P53384 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NUBP1P53384 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUBP1P53384 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUBP1P53384 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NUBP1P53384 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NUBP1P53384 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUBP1P53384 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUBP1P53384 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NUBP1P53384 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
NUBP1P53384 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NUBP1P53384 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NUBP1P53384 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUBP1P53384 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUBP1P53384 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUBP1P53384 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUBP1P53384 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
NUBP1P53384 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUBP1P53384 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NUBP1P53384 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NUBP1P53384 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NUBP1P53384 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NUBP1P53384 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NUBP1P53384 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
NUBP1P53384 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NUBP1P53384 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NUBP1P53384 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NUBP1P53384 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUBP1P53384 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUBP1P53384 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUBP1P53384 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NUBP1P53384 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NUBP1P53384 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NUBP1P53384 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUBP1P53384 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUBP1P53384 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NUBP1P53384 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUBP1P53384 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUBP1P53384 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NUBP1P53384 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NUBP1P53384 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NUBP1P53384 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NUBP1P53384 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NUBP1P53384 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NUBP1P53384 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NUBP1P53384 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NUBP1P53384 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NUBP1P53384 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NUBP1P53384 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NUBP1P53384 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NUBP1P53384 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUBP1P53384 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NUBP1P53384 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUBP1P53384 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
NUBP1P53384 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUBP1P53384 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUBP1P53384 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NUBP1P53384 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NUBP1P53384 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUBP1P53384 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUBP1P53384 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUBP1P53384 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUBP1P53384 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUBP1P53384 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUBP1P53384 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUBP1P53384 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUBP1P53384 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUBP1P53384 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUBP1P53384 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUBP1P53384 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUBP1P53384 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUBP1P53384 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUBP1P53384 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUBP1P53384 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUBP1P53384 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUBP1P53384 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUBP1P53384 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUBP1P53384 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUBP1P53384 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUBP1P53384 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUBP1P53384 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUBP1P53384 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUBP1P53384 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NUBP1P53384 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUBP1P53384 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUBP1P53384 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUBP1P53384 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUBP1P53384 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUBP1P53384 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NUBP1P53384 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUBP1P53384 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUBP1P53384 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUBP1P53384 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms